24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (4324)
>导师招生 (470)
>硕博家园 (271)
>虫友互识 (265)
>文献求助 (232)
>考博 (135)
>招聘信息布告栏 (111)
>博后之家 (52)
>休闲灌水 (39)
>论文投稿 (37)
>基金申请 (30)
>有机交流 (29)
>考研 (26)
>公派出国 (23)
>教师之家 (18)
>找工作 (17)

返回列表

dnvcqw

新虫 (初入文坛)

应助: 5 (幼儿园)
金币: 3605.1
红花: 2
帖子: 32
在线: 33.2小时
虫号: 1903895
注册: 2012-07-21
专业: 生物大分子结构与功能

[求助] 求拟南芥U6序列已有1人参与

如题，因为实验需要需要内参，但但查到序列又不完全一致，还请有谁做过这个实验的帮个忙，先谢了！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

回复此楼

» 猜你喜欢

ALK5 高选择性小分子 LY-3200882：可放大合成路线与质控要点解析已经有0人回复
AM630（CAS 164178-33-0）：CB2 选择性配体的实验使用与供应要点已经有0人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有259人回复
ADC标杆分子T-DM1全解析：从结构设计到实验室应用的技术要点已经有0人回复
HILIC磁珠研究蛋白组学怎么做？已经有0人回复
His标签蛋白纯化怎么才能快？已经有0人回复
WRN变构抑制剂HRO761：从D1/D2界面锁定到MSI合成致死的工具化合物深度解析已经有0人回复
KRAS G12V(ON) 选择性抑制剂 RMC-5127：从三元复合物机制到科研应用已经有0人回复
SHP2 变构抑制剂 Sitneprotafib：从作用机制到科研试剂选型要点已经有0人回复
PRMT5·MTA 抑制剂 MRTX1719 的科研应用已经有0人回复
SW033291 科研使用解析：分子特征、储存与实验获取要点已经有0人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

miRNA做实时定量的内参基因已经有8人回复
内参基因是否恒定啊？？已经有5人回复
克隆拟南芥的基因，为什么每次测序结果出来都是比TAIR网站上标注的序列多出20个碱基呢已经有8人回复
PBI121载体转化拟南芥，Tail-PCR扩增整合位点侧翼序列，为何只扩增得到载体部分序列？已经有16人回复

1楼 2014-03-25 13:45:32

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

biostar2009

专家顾问 (正式写手)

专家经验: +220
MolEPI: 20
应助: 231 (大学生)
金币: 10423.9
散金: 387
红花: 63
帖子: 540
在线: 151.9小时
虫号: 2811882
注册: 2013-11-19
专业: 生物化学
管辖: 分子生物

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dnvcqw(kx444555代发): 金币+3, 鼓励交流 2014-03-26 09:49:41

这种基因的序列确实不太好查，但是也有办法
你在NCBI Nucleotide 栏下，用U6 small nuclear RNA) AND "Arabidopsis thaliana"
6.7.8条目
6.
Arabidopsis thaliana U6-29 snRNA gene
855 bp linear DNA
Accession: X52529.1 GI: 16518
GenBank FASTA Graphics Related Sequences
Select item 16517
7.
Arabidopsis thaliana U6-26 snRNA gene
914 bp linear DNA
Accession: X52528.1 GI: 16517
GenBank FASTA Graphics Related Sequences
Select item 16516
8.
Arabidopsis thaliana U6-1 snRNA gene
795 bp linear DNA
你再点进去看看，大小明显不对，U6 100 nt差不多了，不可能这么大
但是人家还有Ref
REFERENCE 1  (bases 257 to 648)
  AUTHORS Waibel,F. and Filipowicz,W.
  TITLE    U6 snRNA genes of Arabidopsis are transcribed by RNA polymerase III
         but contain the same two upstream promoter elements as RNA
         polymerase II-transcribed U-snRNA genes
  JOURNAL Nucleic Acids Res. 18 (12), 3451-3458 (1990)
PUBMED 2362802
你再进去看看这篇paper，八成这些序列也是他上传的
然后你就可以看见其中的缘由了
不管怎么样
U6是这样一段：
GTCCCTTCGGGGACATCCGATAAAATTGGAACGATACAGAGAAGATTAGCATGGCCCCTGCGCAAGGATGACACGCATAAATCGAGAAATGGTCCAAATTTT

赞一下(3人)

回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

dnvcqw

2楼2014-03-25 20:18:26

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

dnvcqw

新虫 (初入文坛)

应助: 5 (幼儿园)
金币: 3605.1
红花: 2
帖子: 32
在线: 33.2小时
虫号: 1903895
注册: 2012-07-21
专业: 生物大分子结构与功能

送红花一朵

引用回帖:

2楼: Originally posted by biostar2009 at 2014-03-25 20:18:26
这种基因的序列确实不太好查，但是也有办法
你在NCBI Nucleotide 栏下，用U6 small nuclear RNA) AND "Arabidopsis thaliana"
6.7.8条目
6.
Arabidopsis thaliana U6-29 snRNA gene
855 bp linear D ...

受用了，我再试一试，谢谢啦

[ 发自小木虫客户端 ]

赞一下

回复此楼

3楼2014-03-26 19:41:51

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖