| 查看: 4685 | 回复: 21 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
最近在研究autodock.....怎能弄都搞不出来，求大神看看什么原因 已有14人参与
|
|||
|
exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "E:\Drug Design\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' Exception in Tkinter callback Traceback (most recent call last): File "E:\Drug Design\lib\lib-tk\Tkinter.py", line 1403, in __call__ return self.func(*args) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3208, in guiCallback if hasattr(d.ligMol, 'vina_energy'): AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "E:\Drug Design\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "E:\Drug Design\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' 软件装的应该没有问题.....一直错弄不出来。。。。蛋疼。。。求大神解救中。。。。 谢谢！ 配体和受体准备好后，调整完grid，到运行autogrid,时间很短。。。一闪就完了，没见提示success....然后docking,时间很一闪就晚了。。一直这样。。唉，不知道哪里有问题。。 |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
我们一起» 猜你喜欢
投稿Elsevier的杂志（返修），总是在选择OA和subscription界面被踢皮球
已经有6人回复
-
中科院杭州医学所招收博士生一名（生物分析化学、药物递送）
已经有4人回复
-
求个博导看看
已经有18人回复
-
自荐读博
已经有6人回复
-
青基代表作，AAAI之类的A会的special track在国内认可度高吗？还是归为workshop之流？
已经有3人回复
-
上海工程技术大学【激光智能制造】课题组招收硕士
已经有6人回复
-
上海工程技术大学张培磊教授团队招收博士生
已经有4人回复
-
临港实验室与上科大联培博士招生1名
已经有9人回复
-
写了一篇“相变储能技术在冷库中应用”的论文，论文内容以实验为主，投什么期刊合适？
已经有6人回复
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-30 18:48:11
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-30 18:48:11
| 这个问题我以前也遇到过，它是说你准备的配体还没有被赋予配体的属性的意思。配体要从Ligand->Input Ligand导入（不能Read Molecule导入，受体大分子才是Read Molecule导入），然后Selcet选项下加氢（只加极性氢）、分配电荷、指定原子类型，然后Ligand选项下指定根原子、隐藏根原子标记、确定扭转数，在Output Ligand，保存为pdbqt文件格式，才算是配体文件准备好了。再对接试试。 |
12楼2014-05-16 22:14:25
2楼2014-03-23 09:47:57
3楼2014-03-25 06:04:57
4楼2014-03-28 19:27:27