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最近在研究autodock.....怎能弄都搞不出来，求大神看看什么原因 已有14人参与
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exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "E:\Drug Design\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' Exception in Tkinter callback Traceback (most recent call last): File "E:\Drug Design\lib\lib-tk\Tkinter.py", line 1403, in __call__ return self.func(*args) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3208, in guiCallback if hasattr(d.ligMol, 'vina_energy'): AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "E:\Drug Design\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "E:\Drug Design\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "E:\Drug Design\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' 软件装的应该没有问题.....一直错弄不出来。。。。蛋疼。。。求大神解救中。。。。 谢谢！ 配体和受体准备好后，调整完grid，到运行autogrid,时间很短。。。一闪就完了，没见提示success....然后docking,时间很一闪就晚了。。一直这样。。唉，不知道哪里有问题。。 |
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-30 18:48:11
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-30 18:48:11
| 这个问题我以前也遇到过，它是说你准备的配体还没有被赋予配体的属性的意思。配体要从Ligand->Input Ligand导入（不能Read Molecule导入，受体大分子才是Read Molecule导入），然后Selcet选项下加氢（只加极性氢）、分配电荷、指定原子类型，然后Ligand选项下指定根原子、隐藏根原子标记、确定扭转数，在Output Ligand，保存为pdbqt文件格式，才算是配体文件准备好了。再对接试试。 |
12楼2014-05-16 22:14:25
2楼2014-03-23 09:47:57
3楼2014-03-25 06:04:57
4楼2014-03-28 19:27:27