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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » genion 出错
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水儿CoCo

木虫 (小有名气)

[求助] genion 出错 已有3人参与

这是我输入的命令genion -s ions.tpr -o solv_ions.gro -p topol.top -pname NA -nname CL -nn 2


Program genion, VERSION 4.5.5
Source code file: statutil.c, line: 819

Invalid command line argument:
2
For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS
website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors
我想问问大家什么叫无效行啊？
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1楼 2014-03-20 21:18:32
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-21 16:48:24
你这个体系没加离子之前是带正电还是负电的呀，正离子和负离子只用一个就可以，不用写两个命令啊
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gromacs
3楼2014-03-20 23:16:12
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smutao

禁虫 (著名写手)
★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2014-03-21 16:48:17
本帖内容被屏蔽
2楼2014-03-20 21:40:49
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cyl001

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-21 16:48:30
顶楼上  去掉NA  在CL后面加负电荷 即CL-
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4楼2014-03-21 09:24:18
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水儿CoCo

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by fangsteel at 2014-03-20 23:16:12
你这个体系没加离子之前是带正电还是负电的呀，正离子和负离子只用一个就可以，不用写两个命令啊

( ⊙ o ⊙ )啊！鸣人
它带两个正电荷的，我是参照着教程做的，刚开始做，都不会，老出错，哎
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5楼2014-03-21 14:47:51
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