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addict_cy金虫 (小有名气)
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推荐RhesusBase:一个整合1667套人、猴NGS数据的在线资源
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如果你想根据RNA-Seq数据，研究一个基因在人、猴多组织中的表达，剪切和调控, 如果你想直观地在Genome Browser中看人、猴NGS数据的原始reads信息, 如果你想在一个整合有ChIP-Seq, poly(A)-Seq, CLIP-Seq等丰富注释信息的基因组框架下，研究一个基因的调控; 当你发现不同的RNA-Seq数据得到不同结论，纠结于哪一套数据更可靠、是否有规范化的NGS数据质量评分规则时, 当你发现一个基因及其调控模式在人-鼠之间存在巨大差异，想进一步了解在恒河猴中对应的情况时, 当你发现恒河猴的基因结构注释存在大量错误，没法开展分子生物学实验研究时, 请关注我们开发的恒河猴基因组知识库“RhesusBase“: http://www.rhesusbase.org/ 相关文献（如果RhesusBase的数据和分析流程对您的研究有帮助，请引用相应的论文，谢谢）： For RhesusBase Gene Page, Genome Browser and Molecular Evolution Gateway: 1. Evolutionary Interrogation of Human Biology in Well-annotated Genomic Framework of Rhesus Macaque. Molecular Biology and Evolution, 2014. http://mbe.oxfordjournals.org/co ... 03/17/molbev.msu084 2. RhesusBase: a Knowledgebase for the Monkey Research Community. Nucleic Acids Research, 2013. http://nar.oxfordjournals.org/content/41/D1/D892.full For Original NGS Datasets in RhesusBase: - For strand-specific RNA-Seq data in multiple tissues of the same animal, please cite: 3. Hominoid-specific De Novo Protein-coding Genes Originating from Long Non-coding RNAs. PLoS Genetics, 2012 http://www.plosgenetics.org/arti ... ournal.pgen.1002942 - For strand specific RNA-Seq data from multiple tissues, as well as the whole genome sequencing data (60x) of the same animal, please cite: 4. RNA Editome in Rhesus Macaque Shaped by Purifying Selection. PLoS Genetics, 2014, doi:10.1371/ journal.pgen.1004274. in press |
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