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sunic

木虫 (著名写手)

道法自然

[交流] 再花3个金币求教各位高手:cy5、cy3标记原理是什么?

cy5、cy3标记的原理是什么?

cy5、cy3怎样标记蛋白质?

哪位高手知道用cy5或cy3标记蛋白质的实验方法呀?
本人希望用于生物芯片!

补充:我做的是一种新型生物芯片,专门检测特异性蛋白质,但是蛋白质需要染色或标记才能进行检测,国外很多文献都是直接购买已经接好发光基团的蛋白质,而我涉及的蛋白质都比较偏门,需要自己染色。cy5、cy3是最常用,具有相对普遍性,也是仪器设计和易于识别的,但是染色好象不是那么简单,一般的报道这些过程都省略了,而实际中必须用好!

清楚应助者请斑竹帮我送他3个金币(一个问题一个,呵呵)
sunzic@mails.gucas.ac.cn
请勿回答无关话题,谢谢!

未得到有用答案,继续求助!!!
谢谢上面各位虫友的热心帮助,还是要继续求助啊!!!

[ Last edited by sunic on 2008-2-22 at 16:23 ]
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bsksln

银虫 (小有名气)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):谢谢分享,代搂住答谢
你好,我已经把荧光差异双向电泳(DIGE)的一个相关视频,和Ettan DIGE用户手册发到了您的邮箱里,1楼的朋友说的对,我给您的资料里有详细的实验方法。
分子细胞
3楼2008-02-21 03:10:44
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普通回帖

soniabee

铜虫 (初入文坛)


reasonspare(金币+1,VIP+0):谢谢分享,代搂住答谢
晕了
不知道楼主问的是不是DIGE
cy3和cy5是带有不同荧光集团的
不是标记蛋白质,是染色
关于实验方法
不知道你是要具体流程呢还是。。。。
简单的说就是
先用不同的染料与样本混合,比如cy3和样本A混合,cy5和样本b混合
然后将样本A&b混合。
跑2DE
进行扫描,进行分析

不知道lz问这个的目的是什么
如果说的具体点能回答的更有针对性
2楼2008-02-20 21:08:48
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sunic

木虫 (著名写手)

道法自然

谢谢!
不过过程我也知道一些,但不知道原理啊?
Cy3和Cy5的结构是什么啊?怎么反应的?
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4楼2008-02-21 08:39:04
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bsksln

银虫 (小有名气)


reasonspare(金币+1,VIP+0):xiexie 欢迎常来,.
引用回帖:
Originally posted by sunic at 2008-2-21 08:39:
谢谢!
不过过程我也知道一些,但不知道原理啊?
Cy3和Cy5的结构是什么啊?怎么反应的?

据我所知,Ettan DIGE是通用电气开发的一整套系统,各种试剂盒,试验方法,软件,都配备完整,所用的染料Cy3,Cy5很可能是有专利权的。而且搞生命科学的已经对化学物质(生命分子除外)的结构不很感冒了,楼主搞化学吧,化学比较注重结构和机理。
分子细胞
5楼2008-02-21 11:11:33
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sunic

木虫 (著名写手)

道法自然

reasonspare(金币+0,VIP+0):xiexie 关注,虫友已经应助,请及时交流
是啊,不知道怎么结合的,我就没把握操作好
可是网络上找不到具体答案
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6楼2008-02-21 15:11:06
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bsksln

银虫 (小有名气)


reasonspare(金币+1,VIP+0):xiexie 欢迎常来,.
引用回帖:
Originally posted by sunic at 2008-2-21 15:11:
是啊,不知道怎么结合的,我就没把握操作好
可是网络上找不到具体答案

一般分子生物学里的实验都是这样,按照manual操作,或者自己实验室有了一套自己常用的方法,按照做就可以。
而且有些有专利保护的产品,它们的基本原理了解,但具体机理也不是很容易能搞到的。
分子细胞
7楼2008-02-21 22:53:28
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sunic

木虫 (著名写手)

道法自然

未得到有用答案,继续求助!!!
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8楼2008-02-22 08:45:20
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bsksln

银虫 (小有名气)

我又查到了一些相关资料,可能接近师兄的最终答案了,但还是没有完全解决,努力ing

1.http://www.iupac.org/goldbook/C01487.pdf
这个文件里是Cy(cyanine dyes)的general formula,但是Cy2,Cy3,Cy5的具体信息还有待寻找。
其他很多文献里的Cy都是有区别的,R2N+=CH[CH=CH]nNR2是通式。

2.下面两段话,是在通用电气找来的
Minimal labeling dyes
Size and charge matched
3 colors: Cy2, Cy3, Cy5
label ε-amino group of lysine
reactive group:NHS ester

Saturation labeling dyes
Size matched, neutral charge
2 colors: Cy3, Cy5
label thiol group of cysteine
reactive group:Maleimide


我理解的意思是,Ettan DIGE里有两种不同的染料。
一种是叫做“最小标记法染料”,有Cy2,Cy3,Cy5三种,它们的大小匹配,电荷匹配(都带一价正电荷,原因见后)。它们标记ε-NH2,因为ε-NH2带一正电荷,所以被染色后,ε-NH2被标记,没有电荷,而染料带一正电荷,总的来说蛋白的等电点是不变的。reactive group是NHS easter(NHS,丁二酰亚胺)
另一种叫“饱和标记法染料”,有Cy3,Cy5两种,大小匹配,电中性,标记半胱氨酸的巯基。reactive group是maleimide(顺丁烯二酰亚胺)
具体的机理我不明白,师兄根据所提到的基团是不是能推测出来?

[ Last edited by bsksln on 2008-2-22 at 14:42 ]
分子细胞
9楼2008-02-22 11:15:36
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soniabee

铜虫 (初入文坛)

不知道lz的具体用意是什么
肯定不是想用DIGE进行研究

至于原理,建议lz直接写信给GE问
否则在网上也问不出什么来
10楼2008-02-22 13:24:30
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