24小时热门版块排行榜    

查看: 12779  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

银杏叶2

金虫 (小有名气)

[求助] 请问下KEGG代谢通路图里红色和绿色的箭头以及红色的方框的含义~~~~~~~~~ 已有1人参与

如图,我从KEGG pathway里面找到了特定物种的alanine和2-Oxocarboxylic acid代谢通路图,之前看过介绍的帖子说方框里的是酶,而且绿色就是代表这个物种的酶,但是我看到第一张图里面绿色的酶还有一个红色的边框,是代表这个酶增多上调了么?可以认为相应的代谢产物oxaloacetate也增多吗?第二个图里面还有红色的双向箭头以及绿色的单向箭头,双向箭头是代表可以相互转换吗?那么红绿色也是代表着转换速度变快变慢吗?我查了KEGG的help里的color coding,没找到这个介绍呢~~~问题有点多,非常感谢大家能帮忙解答~~~~~~

请问下KEGG代谢通路图里红色和绿色的箭头以及红色的方框的含义~~~~~~~~~
1.JPG


请问下KEGG代谢通路图里红色和绿色的箭头以及红色的方框的含义~~~~~~~~~-1
捕获.JPG

[ Last edited by 银杏叶2 on 2014-3-18 at 12:36 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

银杏叶2

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by libranjie at 2014-03-19 08:58:26
恭喜你,应该是哪里格式什么的有了问题了,不是表达数据,是不会显示上调下调的,看看数据有没有格式问题。...

非常谢谢你~~
5楼2014-03-23 13:33:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

银杏叶2

金虫 (小有名气)

谢谢大家了,我估计是数据的bug,我再点开就没有了,是正常的绿色的图~~~~~~~~~~~~~
2楼2014-03-18 14:35:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

银杏叶2

金虫 (小有名气)

如果从reference pathway里面点进去,再选择特定物种就是正常的,如果从特定物种点进去再选择下面列表里的pathway出来的就有红色标志,然后刷新,就变成正常的绿色的了~~~
3楼2014-03-18 14:56:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

libranjie

木虫 (小有名气)

★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-19 16:03:29
引用回帖:
3楼: Originally posted by 银杏叶2 at 2014-03-18 14:56:20
如果从reference pathway里面点进去,再选择特定物种就是正常的,如果从特定物种点进去再选择下面列表里的pathway出来的就有红色标志,然后刷新,就变成正常的绿色的了~~~

恭喜你,应该是哪里格式什么的有了问题了,不是表达数据,是不会显示上调下调的,看看数据有没有格式问题。
4楼2014-03-19 08:58:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 2rKfVQg2jQww 2026-11-06 16/800 2026-11-09 06:54 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 23/1150 2026-11-07 06:49 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 7/350 2026-11-06 16:43 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 16:43 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 8/400 2026-11-06 16:34 by 5sJFDKp2kwuI
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:23 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 15/750 2026-11-06 13:49 by BkA9Bi5cMhkD
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 17/850 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 09:01 by 2lRNluKrJpwL
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 05:32 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:11 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 kvewwGtKktqB 2026-11-04 11/550 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:15 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:42 by qL1cU46YIdK0
信息提示
请填处理意见