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柯艳萍

铜虫 (初入文坛)

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专业: 微生物遗传学

[求助] Autodock 已有2人参与

本人刚学Autodock，在run autodock时出现cann't creat log file；unsuccessful completion。这是怎么回事啊？求高人指点！谢谢

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1楼 2014-03-17 08:59:48

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philipcpp

铜虫 (初入文坛)

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专业: 生物大分子结构与功能

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-03-19 20:33:17
柯艳萍: 金币+5 2014-03-23 09:47:55

路径设置有3个，最后还有一个是log输出的设置
前三个路径包括auto的两个程序路径都要设置，最好把autogrid和dock都和设置好的配体、受体文件放在一个路径
把log输出的路径设置好，并把这个路径下的同名log文件删掉

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5楼2014-03-19 11:22:15

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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

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红花: 10
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专业: 蛋白质组学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
柯艳萍: 金币+5, ★有帮助 2014-03-18 09:41:16
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-18 16:36:59

确保路径是否正确?路径中不能有中文字符

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2楼2014-03-17 19:04:53

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柯艳萍

铜虫 (初入文坛)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by pymol at 2014-03-17 19:04:53
确保路径是否正确?路径中不能有中文字符

谢谢回复啊，我觉得我这两个问题都不存在啊，前面在run autogrid时没有A.map和NA.map文件，是不是因为这个原因啊

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3楼2014-03-18 09:23:12

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pymol

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月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-18 17:05:32

引用回帖:

3楼: Originally posted by 柯艳萍 at 2014-03-18 09:23:12
谢谢回复啊，我觉得我这两个问题都不存在啊，前面在run autogrid时没有A.map和NA.map文件，是不是因为这个原因啊...

嗯重新构建盒子保存，然后运行autogrid

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4楼2014-03-18 16:57:53

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