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1164028932

金虫 (初入文坛)

[求助] 如何让计算离子从晶体内部扩散到表面的能量?

钡长石晶体在硫酸盐环境中,内部的的钡离子会扩散出去和硫酸根生成硫酸钡,图中的绿颜色的离子是钡离子,怎么样计算钡离子扩散出去的能量呢?

如何让计算离子从晶体内部扩散到表面的能量?
钡长石晶体结构.png

[ Last edited by 1164028932 on 2014-3-16 at 19:35 ]
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
franch: 金币+5, 应助指数+1, 谢谢回帖交流。。。 2014-03-31 22:26:03
引用回帖:
10楼: Originally posted by 1164028932 at 2014-03-30 14:16:14
麻烦你看一下,我根据你的意思建立的反应物与生成物的结构如下图所示,你看一下合理吗?对不对?还有就是优化的时候要固定晶格优化吗?优化时固定其他原子只优化表面原子还是都优化?

reaction.png

production.png
...

OB轴向取的太少了。建议把OB轴向取得再大一些,否则相当于OB向的一条线上的Ba都脱出,这不合理。另外真空层建议至少10A,如果严格的话建议做测试,CASTEP的计算量和晶格大小有关,所以要看能承受多大的计算量了,如果是Dmol3就无所谓,真空层取个三五十A问题都不大。

优化应当作不opt cell(但是因此也有可能造成不收敛)的全几何优化,不要固定,这样拖出前后晶格弛豫的能量会包含在脱出的能量中,也很容易理解,离子脱出后晶格需要重组、再构。不过也有可能会不容易收敛。

不过我估计CASTEP计算这个体系有点危险,速度相当慢(我估计单节点每个structure都要几个小时),因为大致上从尺寸上看K-point基本是gamma了,这样CASTEP就算跨节点也不会有好的效率(CASTEP计算划分是依据K-point的)。速度如果比较慢就不要用Ultrafine,可以降低到fine。另外可以尝试Dmol3(也有可能收敛造成问题)甚至开源的SIESTA或Openmx。差不多的精确程度来看,VASP速度比CASTEP好得多,这个你就要好好请教楼上前辈了。

老菜鸟的一点建议,你先试试吧。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
11楼2014-03-30 16:02:13
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1164028932

金虫 (初入文坛)

怎么没人回答呀?
2楼2014-03-27 09:57:00
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hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

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sunyang1988: 金币+2, 谢谢交流 2014-03-28 09:50:39
1164028932: 金币+105, ★★★★★最佳答案, 回答很好,能否具体说说怎么算扩散能垒 2014-03-28 16:15:32
1164028932: 回帖置顶 2014-03-28 20:53:20
1.仔细研究一下晶体结构,看看有哪些可能的扩散通道;
2.确定晶体可能的暴露面;
3.将上述两点结合起来,确定离子扩散方式,然后象处理化学反应那样,算扩散能垒
4.如果无法确定扩散通道,那就把可能情况都做一下,比较讨论
仅供参考
3楼2014-03-28 09:26:21
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1164028932

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hakuna at 2014-03-28 09:26:21
1.仔细研究一下晶体结构,看看有哪些可能的扩散通道;
2.确定晶体可能的暴露面;
3.将上述两点结合起来,确定离子扩散方式,然后象处理化学反应那样,算扩散能垒
4.如果无法确定扩散通道,那就把可能情况都做一下 ...

你好,麻烦问一下,关键就是钡离子扩散到表面的能垒怎么计算,怎样建模,用什么方法算?
4楼2014-03-28 15:44:00
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