应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » phonopy BORN file
231/3返回列表123下一页
查看: 2398  |  回复: 22
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

pinwei2014

铜虫 (初入文坛)

[求助] phonopy BORN file 已有2人参与

请问这个BORN file 要怎么写？这个校正可以校正什么？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-03-13 13:46:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kwanqsh

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-04-13 12:26:04
This is the content of BORN:
14.400
7.234  0.00  0.00   0.00  7.234  0.00   0.00  0.00  7.234
7.50625  0.0 0.0    0.0 7.50663  0.0     0.0 0.0 7.50630
2.75558  0.0 0.0    0.0 2.75579  0.0     0.0 0.0 2.75560
-2.17866  0.0 0.0    0.0 -2.17886 0.0     0.0 0.0 -5.90230
-2.17866  0.0 0.0    0.0 -5.90230 0.0     0.0 0.0 -2.17863
-5.90211  0.0 0.0    0.0 -2.17886 0.0     0.0 0.0 -2.17863
The first line is the unit conversion factor. For vasp,it is 27.2116*0.52918=14.399834488
第二排就是才OUTCAR里的MACROSCOPIC STATIC DIELECTRIC TENSOR （including tensor。。。
后面是BORN EFFECTIVE CHARGE
。。。
请问您知道这个文件要怎么用吗 我试了好几次算分裂的都不对
赞一下 回复此楼
2楼2014-03-29 11:24:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘仕晨

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-04-13 12:26:40
手册里面有写，这个文件都写的很清楚，不过如果实在不清楚，告诉你一个简单的方法，phonopy的作者已经写好了获取这个文件的脚步，你直接运行就可以，不知道你安装在哪里，如果已经加入环境变量，直接敲入outcar-born命令就可以，或者去你的安装目录找。
主要用于修正LO-TO spliting。
赞一下 回复此楼
3楼2014-03-29 18:35:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kwanqsh

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 刘仕晨 at 2014-03-29 18:35:08
手册里面有写，这个文件都写的很清楚，不过如果实在不清楚，告诉你一个简单的方法，phonopy的作者已经写好了获取这个文件的脚步，你直接运行就可以，不知道你安装在哪里，如果已经加入环境变量，直接敲入outcar-bor ...

请问 有了这个文件和band以后 是直接phonopy --nac运行吗 我这样运行出来的没有分裂
赞一下 回复此楼
4楼2014-03-30 15:16:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘仕晨

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by kwanqsh at 2014-03-30 15:16:18
请问 有了这个文件和band以后 是直接phonopy --nac运行吗 我这样运行出来的没有分裂...

命令是phonopy -p --nac band.conf，除非你不是极性晶体，不然如果计算都正确的话，应该没有问题的
赞一下 回复此楼
5楼2014-03-30 18:19:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

伤心春草

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 刘仕晨 at 2014-03-29 18:35:08
手册里面有写，这个文件都写的很清楚，不过如果实在不清楚，告诉你一个简单的方法，phonopy的作者已经写好了获取这个文件的脚步，你直接运行就可以，不知道你安装在哪里，如果已经加入环境变量，直接敲入outcar-bor ...

感觉outcar-born文件是不太合适的，会报错
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/bin/outcar-born", line 105, in <module>
    symmetrize_tensors=options.symmetrize_tensors)
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/phonopy/interface/vasp.py", line 219, in get_born_OUTCAR
    for x in outcar.readline().split()][1:])
ValueError: could not convert string to float: Berry
手动写了一个born文件搞定了，可是这样太麻烦，有改进的方法么？
好像vasp.py中born有效电荷查找的位置不太对，
查到了Berry附近去了。。
赞一下 回复此楼
且喜且忧，且歌且行
6楼2014-04-11 14:14:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

伤心春草

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by kwanqsh at 2014-03-30 15:16:18
请问 有了这个文件和band以后 是直接phonopy --nac运行吗 我这样运行出来的没有分裂...

请问你的outcar-born能够正常运行么？我的会出楼上的错误。。。
赞一下 回复此楼
且喜且忧，且歌且行
7楼2014-04-11 15:21:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘仕晨

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 伤心春草 at 2014-04-11 15:21:51
请问你的outcar-born能够正常运行么？我的会出楼上的错误。。。...

我之前也是手写的，后来才发现这个脚本的，没有问题，可以正常获取
赞一下 回复此楼
8楼2014-04-11 17:27:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kwanqsh

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 伤心春草 at 2014-04-11 15:21:51
请问你的outcar-born能够正常运行么？我的会出楼上的错误。。。...

我是手动写的 这个outcar-born出现和你的错误一样。。。
赞一下 回复此楼
9楼2014-04-13 20:31:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刘仕晨

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 伤心春草 at 2014-04-11 15:21:51
请问你的outcar-born能够正常运行么？我的会出楼上的错误。。。...

是不是vasp版本的问题啊，你们用的是那个版本的vasp啊，我之前获取正常只有在5.2.2时候用过，5.2.12和5.3都没有测试过。
赞一下 回复此楼
10楼2014-04-14 00:41:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pinwei2014 的主题更新
231/3返回列表123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 271材料工程求调剂 +5 .6lL 2026-03-18 5/250 2026-03-19 03:07 by 无懈可击111
[考研] 311求调剂 +11 冬十三 2026-03-15 12/600 2026-03-18 14:36 by 星空星月
[考研] 312求调剂 +8 陌宸希 2026-03-16 9/450 2026-03-18 12:39 by Linda Hu
[考研] 304求调剂 +12 小熊joy 2026-03-14 13/650 2026-03-18 12:34 by Linda Hu
[考研] 0703化学调剂 +3 妮妮ninicgb 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:29 by macy2011
[考研] 296求调剂 +5 大口吃饭 身体健 2026-03-13 5/250 2026-03-17 21:05 by 不惑可乐
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +16 不知道叫什么！ 2026-03-15 18/900 2026-03-17 17:05 by ruiyingmiao
[考研] 290求调剂 +3 p asserby. 2026-03-15 4/200 2026-03-17 16:35 by wangkm
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林，给自己招师弟中～ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油！? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 一志愿211化学学硕310分求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +3 152697 2026-03-12 4/200 2026-03-13 07:08 by Iveryant
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭