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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » phonopy BORN file
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pinwei2014

铜虫 (初入文坛)

[求助] phonopy BORN file 已有2人参与

请问这个BORN file 要怎么写？这个校正可以校正什么？
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1楼 2014-03-13 13:46:15
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伤心春草

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 刘仕晨 at 2014-03-29 18:35:08
手册里面有写，这个文件都写的很清楚，不过如果实在不清楚，告诉你一个简单的方法，phonopy的作者已经写好了获取这个文件的脚步，你直接运行就可以，不知道你安装在哪里，如果已经加入环境变量，直接敲入outcar-bor ...

感觉outcar-born文件是不太合适的，会报错
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/bin/outcar-born", line 105, in <module>
    symmetrize_tensors=options.symmetrize_tensors)
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/phonopy/interface/vasp.py", line 219, in get_born_OUTCAR
    for x in outcar.readline().split()][1:])
ValueError: could not convert string to float: Berry
手动写了一个born文件搞定了，可是这样太麻烦，有改进的方法么？
好像vasp.py中born有效电荷查找的位置不太对，
查到了Berry附近去了。。
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且喜且忧，且歌且行
6楼2014-04-11 14:14:09
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伤心春草

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by kwanqsh at 2014-03-30 15:16:18
请问 有了这个文件和band以后 是直接phonopy --nac运行吗 我这样运行出来的没有分裂...

请问你的outcar-born能够正常运行么？我的会出楼上的错误。。。
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且喜且忧，且歌且行
7楼2014-04-11 15:21:51
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伤心春草

铜虫 (初入文坛)
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10楼: Originally posted by 刘仕晨 at 2014-04-14 00:41:01
是不是vasp版本的问题啊，你们用的是那个版本的vasp啊，我之前获取正常只有在5.2.2时候用过，5.2.12和5.3都没有测试过。...

好吧，我是5.3版本。目前还不清楚vasp.py怎么改。。哎~
谢谢啊
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且喜且忧，且歌且行
11楼2014-04-14 09:42:52
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伤心春草

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 刘仕晨 at 2014-04-14 09:45:13
我一会试试vasp.5.3的计算，我一会算一个小的example试试看，你的phonopy是什么版本的，虽然我觉得这个影响不大，因为它的那几个脚本好像都不升级的，你可以给作者写个信，告诉他这个事情，应该不能算bug吧。...

phonopy 版本1.8.3.2
麻烦大神~
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且喜且忧，且歌且行
13楼2014-04-14 09:55:35
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伤心春草

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 刘仕晨 at 2014-04-14 14:54:10
奇怪了，我一切正常啊，我用的phonopy-1.8.2，和vasp.5.3.3和vasp.5.2.12一切正常，都可以获取正常的BORN文件，没有问题啊，你们是怎么计算波恩有效电荷的啊，怎么会有“Berry”呢？

最近事有点多，很久没爬上来 。
我就只设了
LEPSILON=.TRUE.
LRPA=.TRUE.
不过好像最近发现这样设置有问题
你的INCAR文件怎么设置的？
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且喜且忧，且歌且行
16楼2014-04-19 21:47:27
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