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luckboylys银虫 (小有名气)
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Amber中NVT、NPT、NVE中的参数设置问题
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首先请允许我小白不懂事。。。 NVT即Canonical Ensemble，在in文件里是不是ntb = 1，tempi = temp0 NPT即Isobaric-Isothermal Ensemble，在in文件是不是ntb = 2 NVE即Microcanonical Ensemble，在in文件是不是ntt = 0， 假如不是，那么NVT、NPT的in文件该如何设置？ 文献中有这样一句话“equilibrated for 50 ps at 300 K using the NVT ensemble”该平衡指的是density.in还是equil.in呢？ 再问，density最终目的是密度平衡，那equil呢？ 谢谢！ |
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