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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » 双酶切
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licunyu

铁虫 (初入文坛)

[求助] 双酶切 已有3人参与

最近在做双酶切（TAKARA家的Xba1/Xho1   共用Buffer为10XM）,想重新构建真核表达载体（目的片段210bp+载体）
1、双酶切（20μl体系，1-3小时都试过），只能切开Xho1位点（与分步酶切对照过）
2、分步双酶切，第一步酶切，不管先切哪个位点，跑胶检测都能切开，但是到第二步酶切结束，想切胶回收的时候，却怎么也跑不出条带来了，只是模糊的一片，像拖带一样，我的DNA去哪儿了？愁死了，求高手指点迷津，感激不尽啊，跪谢！！！

注：关于分步酶切胶回收损失的问题，我特意在第一步酶切结束后，尝试过三种方法 a、切胶回收（测得浓度为60ng左右）  b、不跑胶，直接在原体系里进行第二步酶切  c、不跑胶，直接过柱回收（切胶回收试剂盒，不是专业的DNA分离柱）
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1楼 2014-03-09 15:21:56
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licunyu

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-03-09 21:34:20
的确很奇怪，你第二步酶切加酶量少些，酶切时间控制在30min之内，跑胶再看看有没有目的带。你把你第一次酶切回收的DNA再跑跑看，看看回收后有没有问题。

启发很大，我意识到可能是星活性的问题，本来这个Xho1酶切割效率就高，我之前一直担心切不开而加大了酶量延长了时间，钻进了牛角尖，现在我就在第二步做几个时间梯度试试。非常感谢您！
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6楼2014-03-10 08:32:13
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lihe131

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
licunyu: 金币+1 2014-03-09 16:43:22
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-03-31 18:30:59
不了解你具体的实验过程，但是XbaI是有甲基化位点的，你考虑一下看看有没有中招吧。
祝你成功。
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2楼2014-03-09 16:08:26
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licunyu

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lihe131 at 2014-03-09 16:08:26
不了解你具体的实验过程，但是XbaI是有甲基化位点的，你考虑一下看看有没有中招吧。
祝你成功。

是的，我也看到过关于甲基化的问题，但是我在每一次酶切以后，取小量跑胶，跟原始质粒对比，很明显是切开了。依然感谢您！
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3楼2014-03-09 16:46:09
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-03-10 08:27:51
licunyu: 金币+6, ★★★很有帮助 2014-03-10 08:33:08
的确很奇怪，你第二步酶切加酶量少些，酶切时间控制在30min之内，跑胶再看看有没有目的带。你把你第一次酶切回收的DNA再跑跑看，看看回收后有没有问题。
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hehe
4楼2014-03-09 21:34:20
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