24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 882  |  回复: 5
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

王闯

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】如何用gaussian优化带电分子的构型

想用gaussian98优化一个分子中带有一个碳正离子的有机分子,不知道该怎么建立输入坐标,该使用什么关键字,自旋多重度是多少。
尝试用chem3D建立的分子,电荷总是分布在整个分子中,无法建立电荷在某个原子上的分子,不知道该如何处理。
初来论坛,请高人指点。多谢。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
在量子化学中,没有电荷在哪个原子上的概念,只有整体的电贺和自旋多重度。只要在标题行中写入正确的电贺和自旋多重度即可。

输出文件的atom charge是用算出来得波函数用特定的方法得的

如果使用分子力学的方法,在gaussian手册中有指定特定原子电荷的命令,可以查一下
技术博客:http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
3楼2008-02-03 17:26:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

xalixp

银虫 (小有名气)

我也想知道这个问题
2楼2008-02-03 16:21:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王闯

新虫 (初入文坛)

谢谢三楼的回复。
如果就是要考虑分子中某个原子带电时候的情况怎么办呢,比如酸碱催化时分子上某原子失去一个氢氧根负离子,使得该原子带正电,但是由于电荷被整个分子所分布,使得优化结构中,有时候非失氢氧根原子反而正电性更强,失氢氧根的原子甚至带负电荷,尽管整个分子构型可能是能量最低的,但是没办法由此结构继续讨论本应由该带电原子引起的后续反应了,比如该带电原子对其邻位原子的影响等。
此外,有时候想要通过scan的方法,把一个质子而不是氢原子从其所在的碳原子上拉开,该怎么完成呢。是不是用分子力学的方法在gaussian中也可以实现呢,还请指点,谢谢。
4楼2008-02-03 18:09:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sickboy

银虫 (初入文坛)

这个属于过渡态找寻吧,尚在研究中应该
5楼2008-02-04 08:36:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿中科大材料与化工,353分还有调剂学校吗 +11 否极泰来2026 2026-04-15 13/650 2026-04-20 22:31 by Equinoxhua
[考研] 085600材料与化工调剂 5+3 孜孜不倦2002 2026-04-19 6/300 2026-04-20 21:25 by babero
[论文投稿] 期刊推荐 +3 材料研究生 2026-04-15 5/250 2026-04-20 16:02 by 豆豆7758
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +4 yexuqing 2026-04-19 4/200 2026-04-20 14:47 by brantleo
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 5/250 2026-04-20 10:47 by YuY66
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 通信工程求调剂!!! +7 zlb770521 2026-04-14 7/350 2026-04-19 20:56 by Equinoxhua
[考研] 求调剂推荐 +9 小聂爱学习 2026-04-14 9/450 2026-04-19 17:03 by 中豫男
[考研] 求调剂 +10 小聂爱学习 2026-04-16 12/600 2026-04-19 16:51 by 中豫男
[考研] 085404 22408 309分求调剂 +10 lzmk 2026-04-14 11/550 2026-04-19 16:42 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 294求调剂 +15 淡然654321 2026-04-15 15/750 2026-04-19 08:20 by cuisz
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
[考研] 一志愿A区211,22408 321求调剂 +6 随心所欲☆ 2026-04-15 7/350 2026-04-15 21:45 by lbsjt
信息提示
请填处理意见