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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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Nocturne

管理员

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!


[交流] 大家一般用什么命令限制六圆环,五圆环

有时候由于结构数据不好,我会用Dfix来限制下键长什么的,
但是R因子会增大
有没有比较好的命令呢?谢谢!
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maomao11259

管理员

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Nocturne: 金币+2, 谢谢,能具体说下怎么应用么? 2014-03-07 00:19:27
afix 66限制六元环
afix 55限制五元环
2楼2014-03-06 22:47:24
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maomao11259

管理员

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Nocturne: 金币+2, 我试了下,不行啊,我的是苯环无序,2个苯环共同占有2个C 原子,这种情况如何处理? 2014-04-03 21:19:45
AFIX 66
C1
C2
...
C6
AFIX 0

以此类推,明白了吧?
3楼2014-03-27 22:43:12
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wxc19871115

版主

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Nocturne: 金币+2, 谢谢,学习了 2014-04-16 00:06:52
shelx是不推荐用afix来“限制”五元环和六元环的,而是用sadi和simu之类的“约束”
具体原因可以看shelx说明书
4楼2014-04-15 21:39:19
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
Nocturne: 金币+2, 谢谢,学习了 2014-04-16 00:06:34
afix可以用来限制平面性,但是要结合flat命令使用,4楼说的sad和simu的结合主要用于无需结构或椭球取向不一致的原子精修。
5楼2014-04-15 21:58:19
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wxc19871115

管理员

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Nocturne: 金币+2, 赞成,我现在改成SADI+FLAT 之后好多了,谢谢 2014-04-16 00:06:13
引用回帖:
5楼: Originally posted by jackdeng at 2014-04-15 21:58:19
afix可以用来限制平面性,但是要结合flat命令使用,4楼说的sad和simu的结合主要用于无需结构或椭球取向不一致的原子精修。

谢谢,学习了!
我修的时候一般都是flat+sadi,属于比较软的命令
而afix属于数学模型,很少用,因为数学模型的限制有时候太严格,我的晶体数据又经常很差,所以不敢用这么厉害的命令。而且Agilent的晶体工程师也建议我不要用那些强命令。
但是如果晶体数据非常好的话,用afix还是很方便的。
不一定对,一起交流学习!
6楼2014-04-15 22:10:00
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