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lilongping

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[求助] 怎么用UPGMA法做聚类分析？已有3人参与

如何用UPGMA法做聚类分析，做聚类图之类的？
该用什么软件，具体怎么用法？
如能回复将不胜感激

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1楼2014-03-02 19:09:37

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lilongping

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有没有像spss，或者其他什么软件的具体操作规范啊？求介绍一下啊

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4楼2014-03-02 20:39:50

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Easony

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【答案】应助回帖

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UPGMA 法在算法上较简单。聚类时 ,首先将距离最小的 2 个 OTU 聚在一起 ,并形成一个新的OTU ,其分支点位于 2 个 OTU 间距离的 1/ 2 处;然后计算新的 OTU 与其它 OTU 间的平均距离 ,再找出其中的最小 2 个 OTU 进行聚类;如此反复 ,直到所有的 OTU 都聚到一起 ,最终得到一个完整的系统发生树。

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