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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » DGGE条带聚类分析得到的树状图横线上的数字代表什么意思？有什么意义？
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2011210200

金虫 (小有名气)

[求助] DGGE条带聚类分析得到的树状图横线上的数字代表什么意思？有什么意义？

最近做完了DGGE，学着分析数据，得到了树状图，用邻近法做的树状图。但不太明白横线上的数字有什么意义？望明白的同学指导指导！谢谢！
DGGE条带聚类分析得到的树状图横线上的数字代表什么意思？有什么意义？
聚类分析.jpg
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1楼 2013-07-08 16:29:17
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wtqwcm

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
2011210200: 金币+5, ★有帮助 2013-07-09 12:21:58
数据代表的是出现在某位置的概率，数字越大准确性越高。任意两个分支之间的距离是横向线段长度之和，加和越大说明两个类群间在进化关系上越远
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走好下一步
2楼2013-07-08 17:01:37
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2011210200

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wtqwcm at 2013-07-08 17:01:37
数据代表的是出现在某位置的概率，数字越大准确性越高。任意两个分支之间的距离是横向线段长度之和，加和越大说明两个类群间在进化关系上越远

那具体分析的时候应该如何描述呢？能不能以上图为例，给我讲讲啊，是在是不太懂，谢谢了……
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3楼2013-07-08 21:42:14
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wtqwcm

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
2011210200: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-12-19 10:36:26
前不久放假了没上网，呵呵
一般发育树是用来确定你得到的某一菌株和哪个种比较接近些，比如你的8号和六号在一个分支上，说明它们两个亲缘关系比较近。所以作图时候就需要你在图中添加一些和你自己的菌株接近的已知序列，也叫外围类群。
发育树另外一个用处是大体上观看你得到的这些菌株有几个类群：如1、2、3、4属于一个大的类群；5和7单独一个类群；6、8和9 一个类群。
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走好下一步
4楼2013-07-25 14:29:10
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