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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 农林 » 畜牧兽医 » 怎么用UPGMA法做聚类分析？
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lilongping

新虫 (正式写手)

[求助] 怎么用UPGMA法做聚类分析？ 已有3人参与

如何用UPGMA法做聚类分析，做聚类图之类的？
该用什么软件，具体怎么用法？
如能回复将不胜感激
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1楼 2014-03-02 19:09:37
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Easony

至尊木虫 (知名作家)

老顽童

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
UPGMA 法在算法上较简单。聚类时 ,首先将距离最小的 2 个 OTU 聚在一起 ,并形成一个新的OTU ,其分支点位于 2 个 OTU 间距离的 1/ 2 处;然后计算新的 OTU 与其它 OTU 间的平均距离 ,再找出其中的最小 2 个 OTU 进行聚类;如此反复 ,直到所有的 OTU 都聚到一起 ,最终得到一个完整的系统发生树。
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自信，坚持，善良，真实，简单生活，敢爱敢恨！
2楼2014-03-02 19:26:42
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liangxiaomin

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
好像SPSS 就可以做，具体操作网上都有，不难的，不需要自己编程
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不论你在什么时候开始，重要的是开始之后就不要停止。不论你在什么时候结束，重要的是结束之后就不要悔恨。
3楼2014-03-02 19:55:12
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lilongping

新虫 (正式写手)
有没有像spss，或者其他什么软件的具体操作规范啊？求介绍一下啊
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4楼2014-03-02 20:39:50
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lilongping

新虫 (正式写手)
OTU 是什么啊？这个OTU是怎么解释的啊？
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5楼2014-03-02 20:45:40
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tommylike

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以用NTSYS试试，具体的说明可以在网上搜索到，我试过形态学的数据用这个软件也可以处理，具体的是在EXCEL中录好数据，然后直接保存成97的格式，在软件的转换其中转换。具体的输入格式网上有教程，很简单的。按步骤操作即可，祝你好运。
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6楼2014-03-04 08:02:22
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