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姜志文

新虫 (小有名气)

[交流] 把分子pdb文件修改后无法使用已有5人参与

教程上说用word强制把pdb文件打开,删除所有以HETATM开头的项,可是删完之后,autodock就读不出来了,显示出错,求大神指点……
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ynqjmzq

金虫 (小有名气)

月只蓝: 编辑内容 2014-03-09 10:14
引用回帖:
14楼: Originally posted by 姜志文 at 2014-03-05 23:47:13
不是,是因为我的pdb是用chem3d完成的,文件本身有水,做对接需要删掉并添加极性氢。
...

[回复乱码]

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]

[ Last edited by 月只蓝 on 2014-3-9 at 10:14 ]
海纳百川,有容乃大
16楼2014-03-08 12:38:14
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-28 18:19:42
你可以试试,直接把PDB文件导入VMD,再输出出来,那些HETATM开头的就没有了。
2楼2014-02-28 14:36:43
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百步穿杨999

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-01 10:42:16
每个pdb文件的最后面都要以“END”作为结束

[ 发自小木虫客户端 ]
你的夕阳,我的容颜,谁的三分之一年
4楼2014-03-01 08:44:10
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百步穿杨999

至尊木虫 (著名写手)

每个pdb文件的最后面都要以“END”作为结束

[ 发自小木虫客户端 ]
你的夕阳,我的容颜,谁的三分之一年
5楼2014-03-01 08:46:01
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