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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » NAMD教程第一个例子，就是生成泛素的psf文件出问题
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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橙橙0916

金虫 (小有名气)

[求助] NAMD教程第一个例子，就是生成泛素的psf文件出问题 已有3人参与

求助各位大侠，
我在运行NAMD第一个例子时，运行到生成泛素psf文件时，
就是这一步：
　　　单击 Extension → TK Console 菜单项，弹出VMD Tk  Console窗口。首先用cd命令改变当前目录到namd-tutorial /1-1-build 下。然后输入下列命令：
　　　set ubq [atomselect top protein]
　　　$ubq writepdb ubqp.pdb

其中，我TK控制台在改变当前目录的时候，结果显示：“couldn't change working directory to "e:/Namd-tutorial-1-build": no such file or directory”

求助，这是什么原因呢？

为什么会no such file or directory呢？

[ Last edited by 橙橙0916 on 2014-2-26 at 20:45 ]
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飞跃吧
1楼 2014-02-26 20:43:02
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小小刘亚男

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-05-16 20:04:05
目录明，cd的文件夹不对，还有不能中文命名
赞一下 回复此楼
一切靠自己，让家人过得更好。
4楼2014-05-15 21:59:13
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2014-03-08 09:59:39
可能是你后面的目录名称写错了
赞一下 回复此楼
2楼2014-03-07 14:45:10
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NIFENGGAOHUI

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-22 14:03:37
use   ls    command to make sure ubq.pdb file exist.
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3楼2014-03-22 08:01:00
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6868DSL

新虫 (小有名气)
请教您的问题解决了么？我也遇到了同样的问题
赞一下 回复此楼
5楼2016-01-07 10:15:16
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