应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » NAMD教程第一个例子，就是生成泛素的psf文件出问题
61/1返回列表
查看: 1645  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

橙橙0916

金虫 (小有名气)

[求助] NAMD教程第一个例子，就是生成泛素的psf文件出问题 已有3人参与

求助各位大侠，
我在运行NAMD第一个例子时，运行到生成泛素psf文件时，
就是这一步：
　　　单击 Extension → TK Console 菜单项，弹出VMD Tk  Console窗口。首先用cd命令改变当前目录到namd-tutorial /1-1-build 下。然后输入下列命令：
　　　set ubq [atomselect top protein]
　　　$ubq writepdb ubqp.pdb

其中，我TK控制台在改变当前目录的时候，结果显示：“couldn't change working directory to "e:/Namd-tutorial-1-build": no such file or directory”

求助，这是什么原因呢？

为什么会no such file or directory呢？

[ Last edited by 橙橙0916 on 2014-2-26 at 20:45 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
飞跃吧
1楼 2014-02-26 20:43:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2014-03-08 09:59:39
可能是你后面的目录名称写错了
赞一下 回复此楼
2楼2014-03-07 14:45:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

NIFENGGAOHUI

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-22 14:03:37
use   ls    command to make sure ubq.pdb file exist.
赞一下 回复此楼
3楼2014-03-22 08:01:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小刘亚男

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-05-16 20:04:05
目录明，cd的文件夹不对，还有不能中文命名
赞一下 回复此楼
一切靠自己，让家人过得更好。
4楼2014-05-15 21:59:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

6868DSL

新虫 (小有名气)
请教您的问题解决了么？我也遇到了同样的问题
赞一下 回复此楼
5楼2016-01-07 10:15:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

douwenhui

金虫 (小有名气)
转换到当前那个目录就好了

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
6楼2016-01-08 20:29:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 橙橙0916 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 11:18 by jCd0dEvKHShX
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-29 11:17 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 9/450 2026-08-29 09:59 by jklily
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-29 09:38 by G6APbkg8SA6w
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 09:28 by G6APbkg8SA6w
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭