应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 跪求大神支招，Genbank这么说怎么解释
111/2返回列表12下一页
查看: 2065  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

since_90

至尊木虫 (知名作家)

[求助] 跪求大神支招，Genbank这么说怎么解释 已有2人参与

While processing your GenBank submissions KF933350-KF933352, we have
come across an issue that requires your attention.

Internal stop codons have been detected in the conceptual translation
of the following coding regions:

KF933351
KF933352

If the nucleotide sequences are incorrect, send us the corrected
sequences as a FASTA set and we will replace the current sequences
in your submission.

However, if the sequences in your submission are correct, please
explain the presence of these internal stop codons.

If you are not able to resolve the internal stop codons, your
records can be processed. However, the following note will be
added in the COMMENT field of those with stop codons:

COMMENT GenBank staff is unable to verify sequence and/or annotation
provided by the submitter.

In addition, the relevant information will be removed and the files
will indicate that the data are unverified. Sequences flagged as
unverified will not be included in NCBI BLAST databases.



就是简单的2个16S-rDNA的序列，根本不知道怎么解释为什么会有内终止子存在，咋办
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
Valar morghulis.
1楼 2014-02-26 10:30:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

ifyousee

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-02-26 17:58:16
Internal stop codons have been detected in the conceptual translation
of the following coding regions:
鬼子们序列感觉序列里面有终止密码子，觉得事情变得非常奇怪了。于是让你：如果觉得序列是正确的给他个解释；或是序列错误了给他发个正确版本的序列
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2014-02-26 11:27:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

since_90

至尊木虫 (知名作家)


问题是不知道为啥会有终止密码子的存在，咋回复能糊弄过去
赞一下 回复此楼
Valar morghulis.
3楼2014-02-26 16:40:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by since_90 at 2014-02-26 16:40:42


问题是不知道为啥会有终止密码子的存在，咋回复能糊弄过去

你想糊弄？
人家已经给你几个选择了：
1. 提供正确的序列
2. 不能提供正确的序列，你给个解释，为什么会有internal stop codons
3. 你不能提供正确序列，也不能解释，人家也会给你处理序列，就是加上那么一句话。

其实，你可以再搞一次测序，确认一下你的序列，如果的确是你提交那样的，那没办法，只能提交，如果的确有误，就改正过来再提交。
赞一下 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
4楼2014-02-26 18:10:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

since_90

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gyesang at 2014-02-26 18:10:49
你想糊弄？
人家已经给你几个选择了：
1. 提供正确的序列
2. 不能提供正确的序列，你给个解释，为什么会有internal stop codons
3. 你不能提供正确序列，也不能解释，人家也会给你处理序列，就是加上那么一句话 ...

我想用第二种方法对付他，但是找不到一个好的理由，
重新测序就没有必要了
第三种方法不可取，因为 BLAST不会收录我的序列，这太遗憾了
赞一下 回复此楼
Valar morghulis.
5楼2014-02-26 18:15:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wulv008

银虫 (正式写手)
你好，请问你的这个问题是怎么解决的？我也遇到这种问题了，谢谢！
赞一下 回复此楼
我相信，坚持+努力=成功！
6楼2014-03-14 16:40:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wulv008

银虫 (正式写手)
你好，你的这个问题是怎么解决的？我也遇见这样的问题了，谢谢
赞一下 回复此楼
我相信，坚持+努力=成功！
7楼2014-03-14 16:41:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yxx20060429

新虫 (小有名气)
请问解决了吗？我也遇到了
赞一下 回复此楼
8楼2018-04-11 14:34:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yxx20060429

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by since_90 at 2014-02-26 18:15:57
我想用第二种方法对付他，但是找不到一个好的理由，
重新测序就没有必要了
第三种方法不可取，因为 BLAST不会收录我的序列，这太遗憾了...

请问解决了吗？我也遇到了
赞一下 回复此楼
9楼2018-04-11 14:36:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yxx20060429

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by wulv008 at 2014-03-14 16:40:36
你好，请问你的这个问题是怎么解决的？我也遇到这种问题了，谢谢！

请问解决了吗？我也遇到了
赞一下 回复此楼
10楼2018-04-11 14:36:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 since_90 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 大佬帮着分析今年的评审意见？该课题连续申请了三年了，明年要不要换个方向。 100+3 cai-11138 2026-08-31 11/550 2026-09-06 20:49 by archvillain
[文学芳草园] 两块石头 +7 阿美_Lml888 2026-09-03 10/500 2026-09-06 20:08 by 阿美_Lml888
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:41 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:09 by eObJPa4gWmp6
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:01 by eObJPa4gWmp6
[找工作] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 8/400 2026-09-06 17:49 by eObJPa4gWmp6
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 9/450 2026-09-06 17:09 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才！！！ +5 SCSIOyxguo 2026-09-03 8/400 2026-09-06 15:06 by 可爱小花朵
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[考博] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 12:29 by eObJPa4gWmp6
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 7/350 2026-09-06 11:20 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题，而不是去凝练问题 +10 瞬息宇宙 2026-09-01 19/950 2026-09-06 11:15 by jiangxuan2004
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 8/400 2026-09-06 11:09 by eObJPa4gWmp6
[论文投稿] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-04 8/400 2026-09-06 11:00 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 面上没中，邀请各位路过的虫友分析一下分数 +12 jackleilei 2026-09-03 13/650 2026-09-05 18:10 by fireguard
[文学芳草园] 初秋的晨风 +4 阿美_Lml888 2026-09-04 6/300 2026-09-05 13:51 by 阿美_Lml888
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗？ +6 瞬息宇宙 2026-08-31 9/450 2026-09-05 13:11 by haizai99
[硕博家园] Ei源刊怎么投 +4 Fengshun9711 2026-09-04 4/200 2026-09-04 19:30 by 研途知予
[硕博家园] 哈尔滨工业大学韩晓军教授课题组招收2027年硕士推免生及博士研究生 +3 灯灯灯灯DDDD 2026-09-03 3/150 2026-09-03 21:22 by 科研皮皮猪
[基金申请] 要骂人了，新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西，结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭