24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1749  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

since_90

至尊木虫 (知名作家)

[求助] 跪求大神支招,Genbank这么说怎么解释 已有2人参与

While processing your GenBank submissions KF933350-KF933352, we have
come across an issue that requires your attention.

Internal stop codons have been detected in the conceptual translation
of the following coding regions:

KF933351
KF933352

If the nucleotide sequences are incorrect, send us the corrected
sequences as a FASTA set and we will replace the current sequences
in your submission.

However, if the sequences in your submission are correct, please
explain the presence of these internal stop codons.

If you are not able to resolve the internal stop codons, your
records can be processed. However, the following note will be
added in the COMMENT field of those with stop codons:

COMMENT GenBank staff is unable to verify sequence and/or annotation
provided by the submitter.

In addition, the relevant information will be removed and the files
will indicate that the data are unverified. Sequences flagged as
unverified will not be included in NCBI BLAST databases.



就是简单的2个16S-rDNA的序列,根本不知道怎么解释为什么会有内终止子存在,咋办
回复此楼
Valar morghulis.
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by since_90 at 2014-02-26 16:40:42


问题是不知道为啥会有终止密码子的存在,咋回复能糊弄过去

你想糊弄?
人家已经给你几个选择了:
1. 提供正确的序列
2. 不能提供正确的序列,你给个解释,为什么会有internal stop codons
3. 你不能提供正确序列,也不能解释,人家也会给你处理序列,就是加上那么一句话。

其实,你可以再搞一次测序,确认一下你的序列,如果的确是你提交那样的,那没办法,只能提交,如果的确有误,就改正过来再提交。
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
4楼2014-02-26 18:10:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

ifyousee

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-02-26 17:58:16
Internal stop codons have been detected in the conceptual translation
of the following coding regions:
鬼子们序列感觉序列里面有终止密码子,觉得事情变得非常奇怪了。于是让你:如果觉得序列是正确的给他个解释;或是序列错误了给他发个正确版本的序列
2楼2014-02-26 11:27:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

since_90

至尊木虫 (知名作家)



问题是不知道为啥会有终止密码子的存在,咋回复能糊弄过去
Valar morghulis.
3楼2014-02-26 16:40:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

since_90

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by gyesang at 2014-02-26 18:10:49
你想糊弄?
人家已经给你几个选择了:
1. 提供正确的序列
2. 不能提供正确的序列,你给个解释,为什么会有internal stop codons
3. 你不能提供正确序列,也不能解释,人家也会给你处理序列,就是加上那么一句话 ...

我想用第二种方法对付他,但是找不到一个好的理由,
重新测序就没有必要了
第三种方法不可取,因为 BLAST不会收录我的序列,这太遗憾了
Valar morghulis.
5楼2014-02-26 18:15:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 268分085602化学工程调剂 +31 月照花林。 2026-04-09 31/1550 2026-04-12 23:37 by 学zh
[考研] 085600材料与化工349分求调剂 +8 李木子啊哈哈 2026-04-12 9/450 2026-04-12 22:55 by 李木子啊哈哈
[考研] 求调剂,985材料与化工348分 +9 涵竹刘 2026-04-11 13/650 2026-04-12 22:40 by 涵竹刘
[考研] 346分,工科0854求调剂,专硕 +6 moser233 2026-04-12 7/350 2026-04-12 22:11 by fqwang
[考研] 272分材料子求调剂 +40 Loy0361 2026-04-10 52/2600 2026-04-12 19:23 by laoshidan
[考研] 339求调剂 +8 hanwudada 2026-04-11 9/450 2026-04-12 15:36 by laoshidan
[考研] 材料与化工300求调剂 +39 肖开文 2026-04-09 43/2150 2026-04-12 01:30 by 秋豆菜芽
[考研] 一志愿211,化学310分,本科重点双非,求调剂 +23 努力奋斗112 2026-04-08 23/1150 2026-04-10 23:29 by 314126402
[考研] 一志愿北理工298英一数二已上岸,感谢各位老师 +14 Reframe 2026-04-10 16/800 2026-04-10 23:07 by caotw2020
[考研] 计算机类求调剂,22408-274分 +7 上岸de小虫 2026-04-09 8/400 2026-04-10 19:56 by fxue1114
[考研] 一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂 +20 慕绝cc 2026-04-09 24/1200 2026-04-10 10:22 by xujun0624
[考研] 347材料专硕求调剂 +19 zj8215216 2026-04-06 19/950 2026-04-10 09:36 by 690616278
[考研] 0703化学求调剂 +21 不知名的小卅 2026-04-08 21/1050 2026-04-09 18:55 by l_paradox
[考研] 337求调剂 +4 Gky09300550, 2026-04-09 4/200 2026-04-09 17:18 by 帕尔马拉特
[考研] 277、学硕,求调剂 数一104, +11 瓶子PZ 2026-04-07 12/600 2026-04-07 23:30 by 一只好果子?
[考研] 338求调剂 +5 小猪红色 678 2026-04-06 6/300 2026-04-07 21:18 by 乔哒哒哒
[考研] 071000生物学,一志愿深圳大学296分,求调剂 +12 TIckLw 2026-04-06 13/650 2026-04-07 20:34 by lijunpoly
[考研] 085100建筑学 寻求跨专业调剂 一志愿南大294分 校级省级国家级奖项若干 踏实肯干 +3 1021075758 2026-04-06 4/200 2026-04-07 09:23 by 蓝云思雨
[考研] 327考研调剂推荐 +6 呜呜呜呜呢 2026-04-06 6/300 2026-04-06 21:39 by 啵啵啵0119
[考研] 求调剂到材料 +5 程9915 2026-04-06 5/250 2026-04-06 15:21 by yulian1987
信息提示
请填处理意见