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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求助！查看gromacs的拉伸过程VMD崩溃！
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xueer小雯

金虫 (初入文坛)

[求助] 求助！查看gromacs的拉伸过程VMD崩溃！ 已有1人参与

各位大牛们：
真心来求助！我在做gromacs拉伸后，想用VMD查看拉伸过程，但是一载入trr文件VMD就崩溃，自动关闭。
以下是错误信息：

问题签名:
  问题事件名称:        APPCRASH
  应用程序名:        vmd.exe
  应用程序版本:        1.0.0.1
  应用程序时间戳:        4f2a259f
  故障模块名称:        gromacsplugin.so
  故障模块版本:        0.0.0.0
  故障模块时间戳:        4f29b1c1
  异常代码:        c0000005
  异常偏移:        00004a54
  OS 版本:        6.1.7601.2.1.0.256.1
  区域设置 ID:        2052
  其他信息 1:        0a9e
  其他信息 2:        0a9e372d3b4ad19135b953a78882e789
  其他信息 3:        0a9e
  其他信息 4:        0a9e372d3b4ad19135b953a78882e789


另外，我做了gromacs官网的例子拉伸就没有问题，自己的酒无法查看。

请问大家有谁遇到过这样的问题么？
求解决！！

跪谢！！！
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1楼 2014-02-19 17:05:04
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
xueer小雯: 金币+100, ★★★★★最佳答案 2014-02-19 19:35:37
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-02-19 21:15:30
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

xueer小雯
2楼2014-02-19 18:59:34
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xueer小雯

金虫 (初入文坛)
★
送红花一朵
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-19 21:15:38
引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-02-19 18:59:34
载入轨迹的时候stride调整一下 比如2，3
肯能是step数太多了

大谢！
我把stride调的很大，到10才可以载入frame，而载入后我发现只有22个frames，而我之前有做过好几千的frames的都可以直接打开，您能猜想一下这个是什么原因么？
真是大谢！
赞一下 回复此楼
3楼2014-02-19 19:35:29
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smutao

禁虫 (著名写手)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-19 21:15:45
本帖内容被屏蔽
4楼2014-02-19 19:50:35
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xueer小雯

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by smutao at 2014-02-19 19:50:35
也就是内存爆满了 每一个step读取都会进入内存

那么请问我有办法能调整这个内存的值么？因为之后会有更大的trr文件含有更多的frames。
赞一下 回复此楼
5楼2014-02-19 20:02:46
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smutao

禁虫 (著名写手)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-19 21:15:54
本帖内容被屏蔽
6楼2014-02-19 20:09:36
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xueer小雯

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by smutao at 2014-02-19 20:09:36
楼主可以加个内存条吧 8gb
或者直接用计算集群来看 集群的内存都在64GB甚至更高...

多谢！

感恩！
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7楼2014-02-19 21:00:13
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