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tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] Molpro内存不足 已有9人参与

比如每个核有2GB的内存,我用了"memory,192,m",按照Molpro的说明,是每个核用了192MW=1.5GB内存,可是每次都任务终止,提示"insufficient memory available - require 110715156  have  80466536",难道是说我只有80MW=640MB内存?
于是我就增加核的个数,用64个,128个总行吧?每个核1.5G, 我64个核96G内存了。可是还是同样的错误信息。
于是我就问Molpro,人家答复说:内存的需求不是所有核的累计,不管你用1个核还是100个核,每个核所需要的内存都是一样的。难道我得增加单个核的内存?可是俺们这每个核却只有2GB的内存啊(已经设了1.5GB了)

用过Molpro的虫子出来说说。难道算Molpro的单核都必须有远大于2GB的内存?比如全部是5GB甚至10GB一个核?

我也就是算算CASPT2(5,5),20个原子,一个过渡金属原子,没有对称性

[ Last edited by tiechong on 2014-2-17 at 06:55 ]
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

★ ★ ★ ★ ★ ★
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gkf高: 金币+5 2014-02-19 21:01:22
引用回帖:
13楼: Originally posted by tiechong at 2014-02-19 12:59:04
可不可以说gamess的casscf和caspt2这类的计算也不输给molpro?似乎molpro的ccsd并行还是可以的?但是除此以外molpro对比免费软件gamess优势不大?...

molpro的CASSCF无论是收敛速度还是每一步的计算速度都是最快的,大约比其他程序的CASSCF收敛速度快一个数量级,计算速度快1-2个数量级。其中基于行列式的算法速度最快,基于组态的算法稍慢,但是可以做组态筛选。缺点是对初始波函的质量要求很高,对于极个别的高对称过渡金属体系激发态,有时候结构稍微变一点就不收敛了,或者根本就不收敛。

其他程序的CASSCF收敛速度都相对较慢,往往要迭代几十步到上百步(这里不考虑H2、HF这类Gaussian都能做的简单情况)。不过相对来说,gamess,molcas的CASSCF要好一些,因为每一步迭代的速度还比较快,而且对初始波函的质量不太挑剔,比molpro好养活,但是结果对初始波函有一些依赖性:使用不同的相邻结构产生的初始波函,能量可能有一些差别,虽然误差很小,但是一旦做MRCI或CASPT2,误差就会放大几十到几百倍,导致势能面存在噪声。如果在gamess,molcas里面选一个的话,推荐molcas。虽然gamess包含多个CASSCF以及MCSCF模块,但是不适合初学者,因为关键词、输入风格、功能完全不统一,最早的时候甚至连对称性符号都是各用各的,会把人搞糊涂。特别是功能最多的行列式CASSCF模块,算单重态的时候很有可能会得到来打酱油的三重态。

现在很热门的ORCA程序在CASSCF计算方面仍有欠缺,虽然CASSCF输入风格像molpro一样简单灵活,但是计算速度比Gaussian快点有限。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
14楼2014-02-19 13:41:45
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查看全部 23 个回答

qchem

铁杆木虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请molpro是怎么购买的,多少钱?
这个计算实际需要多少内存呢?像Gaussian是可以估算的
2楼2014-02-17 10:12:19
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kent1022

金虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也是一样的问题,不是设小了就是大了
3楼2014-02-17 15:51:57
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主列一下机器的配置,总共有多少个cpu,多少内存...
另外列一下输入molpro运算时的命令,以及top命令下看到用了几个cpu...
4楼2014-02-17 17:38:18
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