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求解惑，利用MS能模拟分子量几千万的高分子聚合物吗？ 已有4人参与
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| 求解惑，利用MS能模拟分子量几千万的高分子聚合物吗？如果只取聚合物几个节数来模拟，模拟结果与实际是否会相差很大？这个问题一直困扰着我，求解惑，谢谢！ |
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茹此无声
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lsloneil
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【答案】应助回帖
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高分子体系不适合用all-atom MD模拟，不光是计算量的问题，主要是因为高分子体系的势能面非常复杂，local minimum （就是小坑）非常多，如果不升温的话估计体系就掉在某个亚稳态里出不来了。甚至对于有些高分子体系来说势能面上没有一个最稳定的状态，只有若干个能量差不多亚稳态，做MD根本得不到最稳定构象。 但是可以用DPD来模拟高分子的一些性质，这个取决于你DPD的力场，Martini是目前用得比较多得。其他研究高分子体系的结构包括DFT（所谓流体密度泛函是也）和SCFT，这方面我不太了解。 对于只有几个单链的低聚物可以用all-atom MD，算算rdf什么的也没问题。但要把你低聚物得到的性质推广到高聚物，这个就不太好说了，具体看你需要得到什么性质吧。 |
8楼2014-02-04 15:23:07
