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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 算能带outcar卡住不动
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yanzilai

铜虫 (初入文坛)

[求助] 算能带outcar卡住不动 已有3人参与

我在用HSE06算14个原子的能带，用16个核和16G内存，但是每次任务交上去就会卡在
----------------------------------------- Iteration    1(   5)  ---------------------------------------
这会是什么原因？内存不够还是？
我的incar是：

sys=ouyang-BAND

Startparameter for this Run:
   NWRITE =      2;   LPETIM=.TRUE.    write-flag & timer
   ISTART =      1    job   : 0-new  1-cont  2-samecut
   LCHARG =      F
   LWAVE  =      F
   ISPIN  =      1
   ISYM   =      2
   PREC   =      A
   ENCUT  =      550
   ICHARG =      2
#  NBANDS =      90

Electronic Relaxation
   NELM   =      60;
   EDIFF  =      1E-05   stopping-criterion for ELM
   LREAL  =      A

Ionic Relaxation
   IBRION =      -1    ionic relax: 0-MD 1-quasi-New 2-CG
   ISIF   =      2    relax z axiz
   NSW    =      0
   EDIFFG =      -0.01
   POTIM  =      0.50

DOS related values:
   ISMEAR =     0
   SIGMA  =     0.05

Algorithm:
   ALGO  =     FAST
   LHFCALC =    .TRUE.
   HFSCREEN =   0.2
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1楼 2014-01-26 21:30:26
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前田庆次

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2014-01-28 23:23:01
极有可能是内存不够，我这几天也出现类似的状况，后来发现是内存不够
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长枪一横花飘零，松风追月伴我行。无双人间世如梦，倾奇万世永留名。
2楼2014-01-28 15:36:31
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+5, 谢谢回帖交流 2014-01-28 23:23:34
也可能只是算得很慢罷了
要知道
HSE 跟一般 PBE 計算
HSE 大約是慢 20~200 倍左右
做HSE計算的前五步都還是PBE level
所以你可以看一下你前五步大概花多少時間
然後先乘個兩百倍
"大約" 就是你之後每個 ionic loop 要花的時間的 maximun
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3楼2014-01-28 15:41:29
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yanzilai

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 前田庆次 at 2014-01-28 15:36:31
极有可能是内存不够，我这几天也出现类似的状况，后来发现是内存不够

我猜想也是内存不够，但是我已经运行了完了自洽，没有发现内存不够的问题，难道算能带会更加消耗内存吗？
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4楼2014-01-28 16:02:33
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yanzilai

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jpchou at 2014-01-28 15:41:29
也可能只是算得很慢罷了
要知道
HSE 跟一般 PBE 計算
HSE 大約是慢 20~200 倍左右
做HSE計算的前五步都還是PBE level
所以你可以看一下你前五步大概花多少時間
然後先乘個兩百倍
"大約" 就是你之後 ...

因为我原来在做自洽的时候，总共用了5天，走了20步左右。但是算能带，前4步花了不到半小时，第五步一卡就是一天了，还没有动静
赞一下 回复此楼
5楼2014-01-28 16:03:53
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2014-01-28 23:23:51
yanzilai: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-01-29 09:41:35
引用回帖:
5楼: Originally posted by yanzilai at 2014-01-28 16:03:53
因为我原来在做自洽的时候，总共用了5天，走了20步左右。但是算能带，前4步花了不到半小时，第五步一卡就是一天了，还没有动静...

看一下CPU使用率和内存消耗率
如果内存耗尽开始用SWAP了就会非常慢
同时HSE的话这一步要数天是有可能的
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6楼2014-01-28 18:05:37
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
franch: 金币+10, 1ST强帖+1, 应助指数+1, 专家考核, 谢谢回帖交流。。。 好帖！ 2014-01-28 23:25:30
???????:
5?: Originally posted by yanzilai at 2014-01-28 16:03:53
???????????????????????????5??????20???????????????????4???????????С??????岽?????????????????ж???...

"???????????????????????????5??????20???????????????????4???????????С??????岽?????????????????ж???"

?@?????????????????X??????????
????????????
grep  LOO   OUTCAR
??????F????????
      LOOP:  cpu time 7772.68: real time 7784.73
      LOOP:  cpu time 2777.65: real time 2781.95
      LOOP:  cpu time 2748.06: real time 2752.32
      LOOP:  cpu time 2713.43: real time 2717.64
      LOOP:  cpu time 2329.41: real time 2333.00
     LOOP+:  cpu time21358.44: real time21391.56
????r?g (unit in second)
??? cpu time ???? cpu ????????r?g
??? real time ????H?r?g (????cpu???r?g??????Y?????r?g??CPU ??g?????Q?????r?g)
[?°汾VASP???@??????f??汾????????? cpu time and vpu time]

cpu time ???hС? real time
real time ????? cpu time ??????
????????? KalaShayminS ?v??~ ?аl?? SWAP ??



?@?e
?????
????????  HSE ???????? ?!?!?
??????????????????
????@???v??  http://muchong.com/html/201203/4232787.html
HSE ?????????????? IBZKPT ????????? K ?c
K ?c????????????????
HSE ???????????????~ K ?c?@?N?????r~??????????
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7楼2014-01-28 20:54:34
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前田庆次

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yanzilai at 2014-01-28 16:02:33
我猜想也是内存不够，但是我已经运行了完了自洽，没有发现内存不够的问题，难道算能带会更加消耗内存吗？...

在我计算的时候，能带计算所消耗的内存，是弛豫的三倍左右，要具体看你的设置吧，我想，但是前几天我也出现了你这种情况
好了，楼中有两位大神，贫道告退了
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长枪一横花飘零，松风追月伴我行。无双人间世如梦，倾奇万世永留名。
8楼2014-01-29 00:05:44
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yanzilai

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 前田庆次 at 2014-01-29 00:05:44
在我计算的时候，能带计算所消耗的内存，是弛豫的三倍左右，要具体看你的设置吧，我想，但是前几天我也出现了你这种情况
好了，楼中有两位大神，贫道告退了...

感谢~~~
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9楼2014-01-29 09:42:21
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脑仁疼

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by yanzilai at 2014-01-29 09:42:21
感谢~~~...

lz 这个最后是什么原因吗，是因为内存吗

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10楼2016-12-11 15:17:23
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