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vasp_wien2k

新虫 (初入文坛)

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专业: 凝聚态物性 II ：电子结构

[求助] vasp串行，并行编译成功，但很奇怪。已有4人参与

在同样的机子上，同样的系统上，分别进行串行和并行编译vasp5.2，最终均可使用。
但同样的任务，并行耗时却总是串行的2倍，无论是串行耗时几十秒的任务或者串行耗时1个小时的任务。

硬件：双核笔记本四线程，32位ubuntu，
不知原因，请指教。

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1楼2014-01-19 11:44:30

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cahndengbin

新虫 (小有名气)

应助: 10 (幼儿园)
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虫号: 2377020
注册: 2013-03-26
专业: 金属材料的力学行为

引用回帖:

10楼: Originally posted by vasp_wien2k at 2014-01-20 20:09:40
intel 双核cpu，4线程
串行使用vasp命令，top命令下可以看到一个cpu显示100％，另外三个cpu显示基本0.
并行使用mpiexec -np 4 vasp，top命令下可以看到四个cpu同时显示100％，计算结果每次在屏幕上显示4个一样的 ...

我用openmpi编译vasp，然后用mpich2中的mpirun进行vasp并行运算，/opt/mpich2/bin/mpirun -np 4 vasp ，结果跟楼主一样，期待的是单个任务在四个线程分配，实际却是四个线程分别执行相同的任务，即一个任务，每个线程都算了一次。改用openmpi下的mpirun执行，/opt/openmpi/bin/mpirun -np 4 vasp，就正常，显示任务分配在四个节点运算。（running on 4 nodes
distr: one band on 2 nodes, 2 groups）