应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 救急：如何确定同一个种的两株菌是否为同一株菌
283/3返回列表上一页123
查看: 4017  |  回复: 27
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
18楼: Originally posted by 无以终夏 at 2014-01-21 21:53:57
国际上使用比较多的是脉冲场电泳分型技术(PFGE)这个可以通过直观的方式看出两株菌是否具有亲缘关系。
另外一个办法就是通过PCR扩增菌株的保守序列部分然后比对，我毕业实验中使用到的MLST分型技术就是其中之一
...

根据百度百科，PFGE是一种分离大分子DNA的方法。
而我要检测的菌株的同源性肯定非常高，理论上应该是对小分子段的差异进行比较，可能PFGE不适合
PCR扩增菌株的保守序列采用哪一段的啊？我先通过16S rRNA测序，通过NCBI上Blast比对确认到同一个种。然后想进一步比较是否为同一株
MLST分型技术可能用于种间更合适
赞一下 回复此楼
IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
21楼2014-01-22 09:52:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
引用回帖:
20楼: Originally posted by zhangxingc at 2014-01-22 09:28:10
课题需要啊专家...

种之间的鉴定我知道有人是怎么做的，但种内的菌株.....................没注意过，我没看过研究得这么精细的论文，这方面我不是专家。
赞一下 回复此楼
流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
22楼2014-01-22 17:57:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
22楼: Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2014-01-22 17:57:25
种之间的鉴定我知道有人是怎么做的，但种内的菌株.....................没注意过，我没看过研究得这么精细的论文，这方面我不是专家。...

谢谢专家
回复此楼
IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
23楼2014-01-23 10:38:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)
期待更多回复
回复此楼
IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
24楼2014-01-23 17:27:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cz6633

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

用AFLP试一下，选好引物，区分度很高的。
赞一下 回复此楼
25楼2014-01-24 13:37:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

若溪

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-01-24 16:12:20
zhangxingc: 金币+3, ★★★很有帮助, 这是一种新的考虑思路，我还是第一次听说 2014-01-26 11:36:47
我觉得这个类似菌株鉴定，我以前做过细菌的，一般是克隆保守序列16S，扩增产物送去测序，测序结果去NCBI进行Blast,可以查出属于哪一种属，如果你是对两株菌进行鉴定看是否一样，完全可以直接用DNAman直接比对，如果差异碱基不超过3个既可以看成是一株菌
赞一下(1人) 回复此楼
没有比脚更长的路，没有比人更高的山
26楼2014-01-24 15:43:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
26楼: Originally posted by 若溪 at 2014-01-24 15:43:57
我觉得这个类似菌株鉴定，我以前做过细菌的，一般是克隆保守序列16S，扩增产物送去测序，测序结果去NCBI进行Blast,可以查出属于哪一种属，如果你是对两株菌进行鉴定看是否一样，完全可以直接用DNAman直接比对，如果 ...

是吗？如果能这样认定那就太好了。
那请问你有“16SrDNA序列差异碱基不超过3个就可视为同一株”这样的发表文献吗？我需要拿它作证明
赞一下 回复此楼
IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
27楼2014-01-26 11:36:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

g0945111

木虫 (小有名气)
引用回帖:
26楼: Originally posted by 若溪 at 2014-01-24 15:43:57
我觉得这个类似菌株鉴定，我以前做过细菌的，一般是克隆保守序列16S，扩增产物送去测序，测序结果去NCBI进行Blast,可以查出属于哪一种属，如果你是对两株菌进行鉴定看是否一样，完全可以直接用DNAman直接比对，如果 ...

问下，这个三个碱基的根据是怎么来的呢
赞一下 回复此楼
28楼2018-09-11 22:17:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhangxingc 的主题更新
283/3返回列表上一页123
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 27/1350 2026-08-18 21:44 by Noways
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？ +3 瞬息宇宙 2026-08-15 3/150 2026-08-18 21:40 by xiaohuixin
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 9/450 2026-08-18 20:09 by 奶牛小黑
[基金申请] 朋友圈看到的 +4 wangzilk 2026-08-18 5/250 2026-08-18 19:25 by wangzilk
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +51 医学老男孩 2026-08-13 110/5500 2026-08-18 19:07 by icerianxia
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +8 基诺咪客 2026-08-17 11/550 2026-08-18 17:13 by 悠然熊猫
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +9 yuleib84 2026-08-18 10/500 2026-08-18 16:52 by archvillain
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +4 Tide man 2026-08-14 5/250 2026-08-18 11:35 by Tide man
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭