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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 救急:如何确定同一个种的两株菌是否为同一株菌已有7人参与

如题,也可理解为我从网上买过两次标准菌,我该通过分子生物学中哪个方法确认这两株是同一株菌。

请大家帮帮忙
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IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
18楼: Originally posted by 无以终夏 at 2014-01-21 21:53:57
国际上使用比较多的是脉冲场电泳分型技术(PFGE)这个可以通过直观的方式看出两株菌是否具有亲缘关系。
另外一个办法就是通过PCR扩增菌株的保守序列部分然后比对,我毕业实验中使用到的MLST分型技术就是其中之一
...

根据百度百科,PFGE是一种分离大分子DNA的方法。
而我要检测的菌株的同源性肯定非常高,理论上应该是对小分子段的差异进行比较,可能PFGE不适合
PCR扩增菌株的保守序列采用哪一段的啊?我先通过16S rRNA测序,通过NCBI上Blast比对确认到同一个种。然后想进一步比较是否为同一株
MLST分型技术可能用于种间更合适
IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
21楼2014-01-22 09:52:13
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查看全部 28 个回答

pengyaotc

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
克隆保守序列,跑胶比较

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-01-17 18:06:31
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-18 20:18:09
zhangxingc: 金币+10, ★★★很有帮助, 多次热心有效应助,非常感谢 2014-01-22 09:29:57
常用菌株有基因型说明,根据这些特征可以验证两株菌是否同一来源。
做一个阳光、开朗的小和尚
3楼2014-01-18 11:19:01
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-18 20:18:14
我没做过这个。但是我们实验室有确定真菌的。就是扩增,测序。
4楼2014-01-18 11:25:03
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