24小时热门版块排行榜

返回列表

当前主题已经存档。

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

[交流] 【求助】如何在VMD软件能够看到BOX的结构和模拟的过程图像？

请问您
分子动力学模拟时，如何用fortran语言格式编写生成文件，在VMD软件能够看到BOX的结构和模拟的过程图像？不胜感激。

[ Last edited by zzgyb on 2008-1-12 at 16:31 ]

回复此楼

» 猜你喜欢

伦敦大学学院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光谱、催化相关26年博士生已经有11人回复
分子动力学模拟合作需求已经有4人回复
物理化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有139人回复
中国科学院成都山地灾害与环境研究所2026年特别研究助理（博士后）招聘启事已经有0人回复
招生材料与化工、环境科学调剂研究生已经有5人回复
湖北文理学院材料与化工专硕还有调剂名额，欢迎大家推荐考生！已经有1人回复
湖南大学刘巧玲课题组2026年博士研究生招生信息已经有28人回复
南方科技大学表面催化反应动力学研究课题组招收2026届博士生已经有1人回复
北京邮电大学物理学院老师招收博士生已经有2人回复
Comsol 6.0 桶内肥料产热产湿过程模拟求助已经有1人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

1楼 2008-01-11 21:45:09

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

znet0201

金虫 (正式写手)

应助: 8 (幼儿园)
金币: 852.4
散金: 59
红花: 7
帖子: 636
在线: 441.3小时
虫号: 82025
注册: 2005-07-23
专业: 原子和分子物理

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):呵呵谢谢耐心回复

你fortran的程序要输出一个xyz的文件，见附件中是hydrogen的MD trajectory。

VMD自己是没有菜单选项来显示simulation box

可以通过Tcl 脚本实现，见附件（适用于cubic box)。

使用时在Tcl console中source 这个脚本即可。

（这个方法比较笨，应该有更简便的方法，熟悉VMD的同志请跟帖～）

使用是输入draw_cubic [Your box length]

赞一下(10人)

回复此楼

4楼2008-02-23 19:01:40

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 21 个回答

annalolo

应助: (幼儿园)
在线:
虫号: 458030

没人回复？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？？

赞一下

回复此楼

2楼2008-01-14 10:39:51

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖