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seo.d_park

木虫 (正式写手)

[求助] 求助,cloning大侠 基础~已有3人参与

我的Vector 和 Insert DNA 在用限制性内切酶切完后在0.8% agarose gel 上确认了size,切完后size没问题。
Ligation结束后 把 提纯的DNA在0.8%agarose gel上确认,size偏小。
我以为是Insert DNA 和 Vector 的问题,所以把Ligation结束的DNA 取少量用之前的 restriction enzyme又切了一遍,然后确认了size,切完后的size没问题,就是一进行Ligation 然后确认size 就偏小。。(本来应该在4.8kb左右,但是Band在4kb左右.)
vector和 Insert DNA的 size没问题,就是Ligation结束后 比理论上的size(Vector size + Insert DNA size) 小,这到底是为什么啊?
以下是我的5个sample  
Vector size:4679bp
Insert size:225bp,675bp,516bp,720bp,390bp
Ligation 结束后理论上应该是:4.8kb 5.3kb 5.1kb 5.3kb 5kb
求助,cloning大侠 基础~
cut.jpg


求助,cloning大侠 基础~-1
uncut.jpg


求助,cloning大侠 基础~-2
uncut &cut.jpg

[ Last edited by seo.d_park on 2014-1-16 at 11:02 ]
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jkjr111614

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-01-17 12:48:54
seo.d_park: 金币+5 2014-01-17 14:25:25
双链DNA可能有链状,环装,超螺旋的结构,电泳表现不同
就算小提质粒,跑出来还可能有三个大小的条带呢
单酶切一下,再跑
3楼2014-01-16 16:05:16
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