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wangshuang533

银虫 (小有名气)

[求助] 有关建DMSO溶剂盒子的问题 已有1人参与

请教各位大侠如何建立DMSO溶剂盒子啊?我下了packmol,但是貌似也是只能建水盒子的吧?在VMD中有一个溶剂插件,但是生成水盒子以外的溶剂盒子好像也不行。我手上有现成的DMSO盒子的pdb,psf和top文件。但是我想把盒子的尺寸改一下,把原本的尺寸在x,z轴上缩小,在y上加长。不知道哪位大侠能帮帮忙呢。先谢谢各位了!
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木虫上的守望者!
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smutao

禁虫 (著名写手)


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-16 09:48:31
本帖内容被屏蔽

2楼2014-01-15 16:21:33
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wangshuang533

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-01-15 16:21:33
你使用的是charm力场吗?
使用vmd console 的
measure center/minmax

是要用到这个,不过光这个不行。
木虫上的守望者!
3楼2014-01-17 14:26:34
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wangshuang533

银虫 (小有名气)

我已经解决了,还是只用VMD,是一些比较繁琐的方法加起来。比较麻烦,但是最终还是成功的解决了。
木虫上的守望者!
4楼2014-01-17 14:27:37
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