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跃龙门的鱼

银虫 (正式写手)

[求助] 求助：请问各位高手在高斯09中优化单个分子时如何把一部分的参数固定了，优化其他部分 已有3人参与

请问各位高手在高斯09中优化单个分子时如何把一部分的参数固定了，优化其他部分，也就是建一个刚性结构，在高斯中如何操作，非常感谢！
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1楼 2014-01-14 13:00:21
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younggood

铜虫 (小有名气)
可采用部分优化，就是在输入文件中将分子中的坐标中要固定的原子后加-1，要优化的原子后加0即可，比如我想固定前两个碳，其他碳原子优化，我的坐标就是
C       -1          2.49057000    4.69091100   -1.80416000
C       -1          2.21196200    3.36517500   -1.54144100
C        0          1.01053200    3.04638100   -0.89821400
C        0          0.09018500    4.05087300   -0.51831100
C        0          0.41235700    5.39339900   -0.80486500
C        0          1.59215900    5.71033000   -1.43687000
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13楼2015-05-11 16:48:59
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
跃龙门的鱼: 金币+5, ★有帮助 2014-01-14 16:07:42
如果这个片段要参与优化，可用opt=modredundant；
如果这个片段不参与优化，可用opt=readfreeze；
还可以通过ONIOM分层的方式来做。
具体适用方法请翻阅高斯手册
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2楼2014-01-14 13:17:35
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跃龙门的鱼

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-01-14 13:17:35
如果这个片段要参与优化，可用opt=modredundant；
如果这个片段不参与优化，可用opt=readfreeze；
还可以通过ONIOM分层的方式来做。
具体适用方法请翻阅高斯手册

那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段
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3楼2014-01-14 13:42:10
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 跃龙门的鱼 at 2014-01-14 13:42:10
那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段...

可直接在gjf文件里面固定，GV里没试过
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4楼2014-01-14 13:44:21
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