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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » PRODRG转化生成小分子itp文件
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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_蝶飞

铜虫 (小有名气)

[求助] PRODRG转化生成小分子itp文件 已有1人参与

在PRODRG转化生成小分子itp文件的时候，提示只是加上了C上的H，没有羧基H，最初的文件里如果画上羧基H，它也会自动删除，怎么才能得到完整分子的itp文件呢？自己写的话，键长、键角比较麻烦啊。。。求助！！谢谢！！！
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1楼 2014-01-13 16:15:48
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
_蝶飞: 金币+5 2014-01-14 10:17:01
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-19 20:42:35
本帖内容被屏蔽
2楼2014-01-13 19:21:16
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_蝶飞

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-01-13 19:21:16
肯定是自己生成的，楼主使用的什么力场？

是真的需要自己写么？。。。
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3楼2014-01-13 21:08:04
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smutao

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
4楼2014-01-13 21:20:56
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smutao

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
5楼2014-01-13 21:21:22
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水儿CoCo

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by smutao at 2014-01-13 21:21:22
私信我吧
...

亲，我也有同样的问题想要请教你，怎么自己写啊
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6楼2014-03-19 20:11:54
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_蝶飞

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 水儿CoCo at 2014-03-19 20:11:54
亲，我也有同样的问题想要请教你，怎么自己写啊...

写起来很费劲。。直接换分子吧
赞一下 回复此楼
7楼2014-03-27 10:49:50
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水儿CoCo

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by _蝶飞 at 2014-03-27 10:49:50
写起来很费劲。。直接换分子吧...

囧……这个是我的课题额……
赞一下 回复此楼
8楼2014-03-27 14:48:57
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_蝶飞

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 水儿CoCo at 2014-03-27 14:48:57
囧……这个是我的课题额……...

好吧，只能同情你了，我比你好点，都是自己选的，老师只给大方向。
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9楼2014-04-08 11:04:28
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fish637

铜虫 (初入文坛)
楼主，你这个问题解决了吗，能否分享一下啊~
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10楼2014-08-26 22:11:20
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