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xiaxue_121

木虫 (正式写手)

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[交流] [求助]关于gaussian计算中内存和cpu的使用

实验室现在刚配了一台用于Gaussian计算的电脑,基本参数如下:
cpu: Xeon E5335(2颗)
内存: 4G
硬盘: SAS 146G

请教高手
(1)在Gaussian的输入文件中,对cpu的使用该如何写?因为一共有8个核心,是不是 "%nproc=2"就可以了
(2)如何分配内存才可以得到比较好的性能?

万分感谢!!!

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1楼 2008-01-10 17:00:03

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

QC强帖: 3
应助: 61 (初中生)
贵宾: 1.06
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帖子: 2900
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性别: GG
专业: 理论和计算化学

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与，欢迎您常来计算模拟版。

引用回帖:

Originally posted by xiaxue_121 at 2008-1-10 17:00:
实验室现在刚配了一台用于Gaussian计算的电脑,基本参数如下:
cpu: Xeon E5335(2颗)
内存: 4G
硬盘: SAS 146G

请教高手
(1)在Gaussian的输入文件中,对cpu的使用该如何写?因为一共有8个核心,是不是 " ...

你的服务器使用了两个四核心的处理器，一共八个核心，每个核心对Gaussian来说就相当于一个CPU，所以你的电脑在设置时应该按如下方式使用：
1、如果你用的Gaussian版本较老，你只能使用linda才能让所有CPU同时并行，在输入文件的最上面添加
%nprocs=4
%lindaworker=name:2
name指的是你的服务器的在host中的名字，如果没有，你可以用超级用户编辑/etc/hosts，在最下面添加你的服务器的IP地址，空上一两个格，再写上主机名，这个主机名就是那个name，大致格式如下：
192.168.1.111 com (com就是那个name)

2、你可以在本版搜索一个叫Gaussian 03 d02的资源帖，那个版本的软件破除了商业版本四个CPU限制，而且速度较商业版本快了60-70%，如果使用这个版本，你可以直接在输入文件的最上面添加：
%nprocs=8

内存设置, 比较复杂，
如果是hf，DFT等的优化计算，建议设为
%mem=200mw
频率计算要把内存设的小一点，你得电脑大概设成
%mem=50mw,
这样不会出现有几个CPU不干活或者光读硬盘CPU空闲的问题
MP2及更高级的计算，应该把内存设的大一些，可以提高效率
比如设为%mem=400mw

内存多大才能适合你的体系和方法，还要自己多摸索

[ Last edited by hairan on 2008-1-10 at 21:39 ]