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xiaxue_121木虫 (正式写手)
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[交流]
[求助]关于gaussian计算中内存和cpu的使用
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实验室现在刚配了一台用于Gaussian计算的电脑,基本参数如下: cpu: Xeon E5335(2颗) 内存: 4G 硬盘: SAS 146G 请教高手 (1)在Gaussian的输入文件中,对cpu的使用该如何写?因为一共有8个核心,是不是 "%nproc=2"就可以了 (2)如何分配内存才可以得到比较好的性能? 万分感谢!!! |
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2楼2008-01-10 17:20:27
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zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与，欢迎您常来计算模拟版。
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你的服务器使用了两个四核心的处理器，一共八个核心，每个核心对Gaussian来说就相当于一个CPU，所以你的电脑在设置时应该按如下方式使用： 1、如果你用的Gaussian版本较老，你只能使用linda才能让所有CPU同时并行，在输入文件的最上面添加 %nprocs=4 %lindaworker=name:2 name指的是你的服务器的在host中的名字，如果没有，你可以用超级用户编辑/etc/hosts，在最下面添加你的服务器的IP地址，空上一两个格，再写上主机名，这个主机名就是那个name，大致格式如下： 192.168.1.111 com (com就是那个name) 2、你可以在本版搜索一个叫Gaussian 03 d02的资源帖，那个版本的软件破除了商业版本四个CPU限制，而且速度较商业版本快了60-70%，如果使用这个版本，你可以直接在输入文件的最上面添加： %nprocs=8 内存设置, 比较复杂， 如果是hf，DFT等的优化计算，建议设为 %mem=200mw 频率计算要把内存设的小一点，你得电脑大概设成 %mem=50mw, 这样不会出现有几个CPU不干活或者光读硬盘CPU空闲的问题 MP2及更高级的计算，应该把内存设的大一些，可以提高效率 比如设为%mem=400mw 内存多大才能适合你的体系和方法，还要自己多摸索 [ Last edited by hairan on 2008-1-10 at 21:39 ] |
7楼2008-01-10 21:36:58
xiaxue_121
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8楼2008-01-11 17:34:34