24小时热门版块排行榜    

查看: 1884  |  回复: 1

ysx0226

金虫 (小有名气)

[求助] 请教RNAseq前期样品的配置 已有1人参与

最近要做一种植物关于盐的胁迫的转录组,包括其不同耐性品种的筛选,实验是水培的
请教:
1.取样的时期应该怎么选择,是不是苗越小越好,只要取样的量能够满足就行
2.怎么确定取样的部位,地上还是地下部分,是不是找到应激反映最强烈的组织,做根部的可以么
3.怎么在盐的浓度梯度中选择测序需要的处理组,不同品种是不是应该选择相同的处理浓度,或者有什么指标之类的
4.处理的时间怎么选,是等性状表现了巨大的差异再提RNA还是短时间处理就可以取样了
回复此楼
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woody196

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
ysx0226(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-04-02 08:28:42
取样时期最好是能够包括植物生长发育的各个时期最好而不是越小越好,因为幼苗时期可能植物的一些基因都还没有表达,最好是根茎叶不同时期的都有,你处理的盐浓度肯定各个组中应该是一致的不然后期怎么作对比,我觉得植物对盐胁迫应该是有一个响应的过程吧,所以肯定不能处理完很快就取样,最起码看出有些差异时候在取样这样后期的结果应该会更好一点~~
2楼2014-04-02 08:12:27
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ysx0226 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 14:24 by jCd0dEvKHShX
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-29 14:15 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +5 gdd2018 2026-08-28 10/500 2026-08-29 14:10 by Jacob678
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:02 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:40 by jCd0dEvKHShX
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:29 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 9/450 2026-08-29 09:59 by jklily
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-29 09:26 by G6APbkg8SA6w
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见