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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 华大基因测序文件怎么分析？用什么软件？求生物信息学高人
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dulei

木虫 (小有名气)

[交流] 华大基因测序文件怎么分析？用什么软件？求生物信息学高人

从华大基因测了一个菌株，测序文件用UltraEdit打开，应该是read数据，每个read长度90bp。
怎么把这些read整合成contig和scaffold？？用什么软件分析？来个教程。
从来没有接触过生物信息学，表示一点也不懂。
求教。
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1楼 2014-01-02 10:35:22
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
tophat
或者
trinity
这两个都需要有比较强计算能力的服务器
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3楼2014-01-11 06:23:48
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unforget408

铜虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wizardfan: 金币+2, 鼓励发帖交流 2014-01-11 06:24:13
能先把数据格式贴出来吗？再说明你要干什么
赞一下 回复此楼
2楼2014-01-10 23:13:17
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