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dulei

木虫 (小有名气)

应助: 8 (幼儿园)
金币: 1426.9
帖子: 209
在线: 74.5小时
虫号: 593568

[交流] 华大基因测序文件怎么分析？用什么软件？求生物信息学高人

从华大基因测了一个菌株，测序文件用UltraEdit打开，应该是read数据，每个read长度90bp。
怎么把这些read整合成contig和scaffold？？用什么软件分析？来个教程。
从来没有接触过生物信息学，表示一点也不懂。
求教。

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1楼 2014-01-02 10:35:22

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unforget408

铜虫 (正式写手)

应助: 12 (小学生)
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在线: 52.4小时
虫号: 2918678

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wizardfan: 金币+2, 鼓励发帖交流 2014-01-11 06:24:13

能先把数据格式贴出来吗？再说明你要干什么

2楼2014-01-10 23:13:17

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

tophat
或者
trinity
这两个都需要有比较强计算能力的服务器

3楼2014-01-11 06:23:48

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