| 查看: 142 | 回复: 3 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者longknife将赠送您 8 个金币 | |||
[求助]
求助生物信息学问题---如何通过Blast寻找新基因
|
|||
|
生物信息学的选修课作业，寻找一个“新基因”，其中有些地方不明白，请教高手。 该作业要求： 1. 找到一个已知功能的蛋白质； 2. 通过tBLASTn找到一个DNA (mRNA)序列；(1) 这个DNA多属少见物种，该DNA (mRNA)序列除了Source外没有任何注释；(2) 通过ORF finder找到该DNA (mRNA)序列所编码的蛋白质；（3）通过Blastp证实该蛋白质与已知功能的蛋白质同源，且要求该Blastp结果中没有该物种的蛋白（说明该序列为新基因）。 有两个问题不太清楚： 1. 什么叫“除了Source外没有其他任何注释”，包括Defination和comment吗，有些标明通过computer pridict的序列是否算新基因，能否举个例子。 2. 做Blastp的时候，结果中是不能有该物种的任何蛋白还是只是不能有你通过ORF Finder找到的蛋白质？ 期待高手的帮助，如果能列出详细步骤更好，多谢。 |
回复此楼» 猜你喜欢
恳请有学校收留
已经有6人回复
-
求调剂推荐
已经有8人回复
-
0854求调剂
已经有14人回复
-
300求调剂
已经有9人回复
-
291求调剂
已经有7人回复
-
289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校)
已经有4人回复
-
初试324 中药学 一志愿天中医 求调剂
已经有3人回复
-
药学求调剂
已经有14人回复
-
327求调剂
已经有27人回复
-
急需调剂
已经有5人回复
Lbubu
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 15.2
- 散金: 50
- 帖子: 175
- 在线: 52.4小时
- 虫号: 366393
- 注册: 2007-05-09
- 性别: MM
- 专业: 生物化学与分子生物学
2楼2008-01-04 19:07:32
Lbubu
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 15.2
- 散金: 50
- 帖子: 175
- 在线: 52.4小时
- 虫号: 366393
- 注册: 2007-05-09
- 性别: MM
- 专业: 生物化学与分子生物学
3楼2008-01-04 19:13:55
4楼2008-01-05 21:28:39
