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柠檬可乐星

新虫 (小有名气)


[交流] 关于引物的基本概念

做分子也有一段时间了,可是今天突然恍惚了,发现自己很多最基本的概念都搞不清出,上网查,发现也很混乱,关于引物的一些概念,请各位大虾指点:
1、上游引物、正向引物、正义引物是不是同一概念?
2、有人说“上游引物与正向序列也就是正义链的序列是相同的,下游引物与正义链反相互补及与反义链相同。”可是我还查到有说“与mRNA相同的引物为正义引物,而与其互补的是反义引物。”这两种说法正好相反吧,究竟哪个是对的?

还有今天看到一个很早之前别人发的帖子,问题最终没有解决,在这里各位大神讨论一下吧:
如果设计一个引物与模板链互补(注意不是反向互补),那么它能与模板链结合,并完成延伸吗?
举个例子:模板链:5'-ACTTGACGTGCATCG
引物(随便写的,仅供分析该例)5'-CTGCACGT
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)


★ ★ ★ ★
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柠檬可乐星: 金币+1 2013-12-26 14:59:16
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-26 15:04:01
上游引物不清楚,我想是在基因正义链上游
正义链序列与mRNA序列一致,模板链是负链。Forward引物扩增出正链,Reverse引物扩增出负链。
5楼2013-12-26 13:58:19
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sj082csh

银虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★ ★
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送红花一朵
柠檬可乐星: 金币+3 2013-12-26 14:59:39
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-26 15:03:47
1、一般都以mRNA为基准,而且引物的方向为5’→3',引物若与mRNA序列相同,即在正义链(就DNA来说,也叫编码链)上,则是正向引物,而反向引物与mRNA序列是反向互补的,在反义链上(就DNA来说,也叫模板链);你说的这几个名称应是同一概念;
2、“与mRNA相同的引物为正义引物,而与其互补的是反义引物”这一句的后半句应该是漏掉了反向两字,应是“反向互补”
2楼2013-12-25 17:46:29
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)


★ ★ ★ ★ ★
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柠檬可乐星: 金币+2 2013-12-26 14:59:22
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-26 15:03:55
我没弄清楚你到底在纠结什么。
1. 应该是相同的。
2. 你说的两个说法都是对的。正义链有基因编码信息,与mRNA的序列相同,转录时不作为模板。反义链与正义链反向互补,转录mRNA的模板链。上游引物或者正义引物是与mRNA序列一致的,它在PCR扩增时是与反义链配对。
你举的例子有问题,无法做分析。
3楼2013-12-26 03:54:18
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柠檬可乐星

新虫 (小有名气)


给位大侠的讲解很清楚了,我想我已经明白了,但还是想最后确定一下,传的图是我在网上看到的,他很肯定的说是从教科书上总结来的,但现在看来应该是错误的吧,请大虾们再帮我确定下
关于引物的基本概念
F04K]I2Z6MII4)IWKGNOM8E.jpg

6楼2013-12-26 15:02:53
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