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关于引物的基本概念
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做分子也有一段时间了,可是今天突然恍惚了,发现自己很多最基本的概念都搞不清出,上网查,发现也很混乱,关于引物的一些概念,请各位大虾指点: 1、上游引物、正向引物、正义引物是不是同一概念? 2、有人说“上游引物与正向序列也就是正义链的序列是相同的,下游引物与正义链反相互补及与反义链相同。”可是我还查到有说“与mRNA相同的引物为正义引物,而与其互补的是反义引物。”这两种说法正好相反吧,究竟哪个是对的? 还有今天看到一个很早之前别人发的帖子,问题最终没有解决,在这里各位大神讨论一下吧: 如果设计一个引物与模板链互补(注意不是反向互补),那么它能与模板链结合,并完成延伸吗? 举个例子:模板链:5'-ACTTGACGTGCATCG 引物(随便写的,仅供分析该例)5'-CTGCACGT |
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gyesang
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gyesang: 回帖置顶 2014-01-29 16:20:27
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1、上游引物、正向引物、正义引物是同一概念 英文名叫: forward and Reverse primer sense and anti-sense primer Upper and Lower primer 这些说法都是正确的 2、有人说“上游引物与正向序列也就是正义链的序列是相同的,下游引物与正义链反相互补及与反义链相同。”可是我还查到有说“与mRNA相同的引物为正义引物,而与其互补的是反义引物。”这两种说法正好相反吧,究竟哪个是对的? 所谓正义链就是与mRNA序列(U替换为T)相同的DNA链为正义链或者有义链,所以两个说法是同一个意思,没有相反的意思在里面 3、如果设计一个引物与模板链互补(注意不是反向互补),那么它能与模板链结合,并完成延伸吗? 举个例子:模板链:5'-ACTTGACGTGCATCG 引物(随便写的,仅供分析该例)5'-CTGCACGT 互补的序列在哪里呢?请明示 |
7楼2013-12-26 15:10:50
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1、一般都以mRNA为基准,而且引物的方向为5’→3',引物若与mRNA序列相同,即在正义链(就DNA来说,也叫编码链)上,则是正向引物,而反向引物与mRNA序列是反向互补的,在反义链上(就DNA来说,也叫模板链);你说的这几个名称应是同一概念; 2、“与mRNA相同的引物为正义引物,而与其互补的是反义引物”这一句的后半句应该是漏掉了反向两字,应是“反向互补” |
2楼2013-12-25 17:46:29
3楼2013-12-26 03:54:18
5楼2013-12-26 13:58:19
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gyesang
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