24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 4836  |  回复: 10

柠檬可乐星

新虫 (小有名气)


[交流] 关于引物的基本概念

做分子也有一段时间了,可是今天突然恍惚了,发现自己很多最基本的概念都搞不清出,上网查,发现也很混乱,关于引物的一些概念,请各位大虾指点:
1、上游引物、正向引物、正义引物是不是同一概念?
2、有人说“上游引物与正向序列也就是正义链的序列是相同的,下游引物与正义链反相互补及与反义链相同。”可是我还查到有说“与mRNA相同的引物为正义引物,而与其互补的是反义引物。”这两种说法正好相反吧,究竟哪个是对的?

还有今天看到一个很早之前别人发的帖子,问题最终没有解决,在这里各位大神讨论一下吧:
如果设计一个引物与模板链互补(注意不是反向互补),那么它能与模板链结合,并完成延伸吗?
举个例子:模板链:5'-ACTTGACGTGCATCG
引物(随便写的,仅供分析该例)5'-CTGCACGT
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

小知识

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 回帖置顶 2014-01-29 16:20:27
1、上游引物、正向引物、正义引物是同一概念
英文名叫: forward and Reverse primer
               sense and anti-sense primer
               Upper and Lower primer
这些说法都是正确的

2、有人说“上游引物与正向序列也就是正义链的序列是相同的,下游引物与正义链反相互补及与反义链相同。”可是我还查到有说“与mRNA相同的引物为正义引物,而与其互补的是反义引物。”这两种说法正好相反吧,究竟哪个是对的?
所谓正义链就是与mRNA序列(U替换为T)相同的DNA链为正义链或者有义链,所以两个说法是同一个意思,没有相反的意思在里面

3、如果设计一个引物与模板链互补(注意不是反向互补),那么它能与模板链结合,并完成延伸吗?
举个例子:模板链:5'-ACTTGACGTGCATCG
引物(随便写的,仅供分析该例)5'-CTGCACGT

互补的序列在哪里呢?请明示
7楼2013-12-26 15:10:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

sj082csh

银虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送红花一朵
柠檬可乐星: 金币+3 2013-12-26 14:59:39
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-26 15:03:47
1、一般都以mRNA为基准,而且引物的方向为5’→3',引物若与mRNA序列相同,即在正义链(就DNA来说,也叫编码链)上,则是正向引物,而反向引物与mRNA序列是反向互补的,在反义链上(就DNA来说,也叫模板链);你说的这几个名称应是同一概念;
2、“与mRNA相同的引物为正义引物,而与其互补的是反义引物”这一句的后半句应该是漏掉了反向两字,应是“反向互补”
2楼2013-12-25 17:46:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)


★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
柠檬可乐星: 金币+2 2013-12-26 14:59:22
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-26 15:03:55
我没弄清楚你到底在纠结什么。
1. 应该是相同的。
2. 你说的两个说法都是对的。正义链有基因编码信息,与mRNA的序列相同,转录时不作为模板。反义链与正义链反向互补,转录mRNA的模板链。上游引物或者正义引物是与mRNA序列一致的,它在PCR扩增时是与反义链配对。
你举的例子有问题,无法做分析。
3楼2013-12-26 03:54:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)


★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
柠檬可乐星: 金币+1 2013-12-26 14:59:16
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-26 15:04:01
上游引物不清楚,我想是在基因正义链上游
正义链序列与mRNA序列一致,模板链是负链。Forward引物扩增出正链,Reverse引物扩增出负链。
5楼2013-12-26 13:58:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠檬可乐星

新虫 (小有名气)


给位大侠的讲解很清楚了,我想我已经明白了,但还是想最后确定一下,传的图是我在网上看到的,他很肯定的说是从教科书上总结来的,但现在看来应该是错误的吧,请大虾们再帮我确定下
关于引物的基本概念
F04K]I2Z6MII4)IWKGNOM8E.jpg

6楼2013-12-26 15:02:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠檬可乐星

新虫 (小有名气)


引用回帖:
7楼: Originally posted by gyesang at 2013-12-26 15:10:50
1、上游引物、正向引物、正义引物是同一概念
英文名叫: forward and Reverse primer
               sense and anti-sense primer
               Upper and Lower primer
这些说法都是正确的

2、有人说“上 ...

关于第3个问题,好像是我搞错了,例子举得不恰当,我以为引物序列5'-CTGCACGT和模板链从5'端第5个碱基开始是互补关系呢
8楼2013-12-26 16:29:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by 柠檬可乐星 at 2013-12-26 16:29:09
关于第3个问题,好像是我搞错了,例子举得不恰当,我以为引物序列5'-CTGCACGT和模板链从5'端第5个碱基开始是互补关系呢...

方向错误,没有5‘和5’互补的
9楼2013-12-27 00:32:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠檬可乐星

新虫 (小有名气)


引用回帖:
9楼: Originally posted by gyesang at 2013-12-27 00:32:12
方向错误,没有5‘和5’互补的...

您说的是反向互补吧?
比如5'-ATTGC
它的互补链不是5'-TAACG吗?
反向互补才是5’-GCAAT吧?
10楼2013-12-27 08:53:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
10楼: Originally posted by 柠檬可乐星 at 2013-12-27 08:53:52
您说的是反向互补吧?
比如5'-ATTGC
它的互补链不是5'-TAACG吗?
反向互补才是5’-GCAAT吧?...

互补链是3'-TAACG 好吧
11楼2013-12-27 14:56:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
sjmr12214楼
2013-12-26 08:22   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 柠檬可乐星 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 招收生物学/细胞生物学调剂 +4 IceGuo 2026-03-26 5/250 2026-03-29 01:25 by griffith2014
[考研] 085600,专业课化工原理,321分求调剂 +4 大馋小子 2026-03-28 4/200 2026-03-29 00:32 by 544594351
[考研] 材料学硕333求调剂 +10 北道巷 2026-03-24 10/500 2026-03-28 23:06 by 无际的草原
[考研] 求调剂 +3 QiMing7 2026-03-25 4/200 2026-03-28 14:30 by QiMing7
[考研] 086502化学工程342求调剂 +6 阿姨复古不过 2026-03-27 6/300 2026-03-28 07:06 by wangy0907
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +15 荷包蛋hyj 2026-03-26 15/750 2026-03-28 04:13 by fmesaito
[考研] 化学调剂 +4 爱吃番茄的旭 2026-03-24 5/250 2026-03-27 17:50 by kiokin
[考研] 材料292调剂 +12 橘颂思美人 2026-03-23 12/600 2026-03-27 15:44 by caszguilin
[考研] 287求调剂 +10 land xuxu 2026-03-26 10/500 2026-03-27 15:33 by 帕尔马拉特
[考研] 安徽大学专硕生物与医药专业(086000)324分,英语已过四六级,六级521,求调剂 +4 美味可乐鸡翅 2026-03-26 4/200 2026-03-27 15:27 by 星空星月
[考研] 276求调剂。有半年电池和半年高分子实习经历 +10 材料学257求调剂 2026-03-23 11/550 2026-03-27 10:13 by YCIT- LHL
[考研] 341求调剂 +7 青柠檬1 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:19 by wxiongid
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-26 6/300 2026-03-26 18:03 by 邱gl
[考研] 289求调剂 +17 硕星赴 2026-03-23 17/850 2026-03-26 16:18 by 不吃魚的貓
[考研] 302求调剂 +4 锦衣卫藤椒 2026-03-25 4/200 2026-03-25 16:29 by 功夫疯狂
[考研] 282求调剂 +3 wcq131415 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:16 by userper
[考研] 生物学学硕求调剂 +7 小羊睡着了? 2026-03-23 10/500 2026-03-25 02:24 by 清风拂扬。 m
[考研] 材料专硕331求调剂 +4 鲜当牛 2026-03-24 4/200 2026-03-24 15:58 by JourneyLucky
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
[考研] 求老师收我 +3 zzh16938784 2026-03-23 3/150 2026-03-23 12:56 by ztnimte
信息提示
请填处理意见