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[交流]
关于引物的基本概念
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做分子也有一段时间了，可是今天突然恍惚了，发现自己很多最基本的概念都搞不清出，上网查，发现也很混乱，关于引物的一些概念，请各位大虾指点： 1、上游引物、正向引物、正义引物是不是同一概念？ 2、有人说“上游引物与正向序列也就是正义链的序列是相同的，下游引物与正义链反相互补及与反义链相同。”可是我还查到有说“与mRNA相同的引物为正义引物，而与其互补的是反义引物。”这两种说法正好相反吧，究竟哪个是对的？ 还有今天看到一个很早之前别人发的帖子，问题最终没有解决，在这里各位大神讨论一下吧： 如果设计一个引物与模板链互补（注意不是反向互补），那么它能与模板链结合，并完成延伸吗？ 举个例子：模板链：5'-ACTTGACGTGCATCG 引物（随便写的，仅供分析该例）5'-CTGCACGT |
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 小知识 |
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gyesang
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gyesang: 回帖置顶 2014-01-29 16:20:27
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1、上游引物、正向引物、正义引物是同一概念 英文名叫: forward and Reverse primer sense and anti-sense primer Upper and Lower primer 这些说法都是正确的 2、有人说“上游引物与正向序列也就是正义链的序列是相同的，下游引物与正义链反相互补及与反义链相同。”可是我还查到有说“与mRNA相同的引物为正义引物，而与其互补的是反义引物。”这两种说法正好相反吧，究竟哪个是对的？ 所谓正义链就是与mRNA序列（U替换为T）相同的DNA链为正义链或者有义链，所以两个说法是同一个意思，没有相反的意思在里面 3、如果设计一个引物与模板链互补（注意不是反向互补），那么它能与模板链结合，并完成延伸吗？ 举个例子：模板链：5'-ACTTGACGTGCATCG 引物（随便写的，仅供分析该例）5'-CTGCACGT 互补的序列在哪里呢？请明示 |
7楼2013-12-26 15:10:50
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1、一般都以mRNA为基准，而且引物的方向为5’→3'，引物若与mRNA序列相同，即在正义链（就DNA来说，也叫编码链）上，则是正向引物，而反向引物与mRNA序列是反向互补的，在反义链上（就DNA来说，也叫模板链）；你说的这几个名称应是同一概念； 2、“与mRNA相同的引物为正义引物，而与其互补的是反义引物”这一句的后半句应该是漏掉了反向两字，应是“反向互补” |
2楼2013-12-25 17:46:29
3楼2013-12-26 03:54:18
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gyesang
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