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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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vividhu

木虫 (正式写手)

[求助] ortep diagram的键正常,但是packing diagram时产生不存在的键 已有1人参与

最近在用xp做晶胞堆积图,在画ORTEP diagram(图1)的时候还是正确的, O4‘A 和O4A,可能因为没有显示氢键,所以看起来还是正常的。
但是在packing diagram中(图2),就看到产生了不存在的键,就是O和H被连接在一起了,具体有O4’-H13A、O4‘-H13B、O4-H13C和O4-H13D这一类型的键,我尝试了undo Atom1 atom2的命令,可是还是删不掉啊,是我的解析文件里面错误了吗?这个怎么改正呢?
ortep diagram的键正常,但是packing diagram时产生不存在的键
图1
ortep diagram的键正常,但是packing diagram时产生不存在的键-1
图2
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“人定胜天”,这个“定”不是“一定”的“定”,而是“镇定”的“定”,人要是镇定下来,是能够应付各种各样的灾难。
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forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
vividhu: 金币+1, 有帮助 2013-12-27 08:43:16
checkcif还有明显的错误没有?无序处理是否得当?是在不行就换别的软件,比如Diamond。
2楼2013-12-26 21:27:52
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vividhu

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by forever1706 at 2013-12-26 21:27:52
checkcif还有明显的错误没有?无序处理是否得当?是在不行就换别的软件,比如Diamond。

checkcif已经没有明显的错误了,无序我也不清楚啊,当时这个无序分的本来就不是很清楚,diamond我画不好,主要是生成的图片,感觉不清晰啊
“人定胜天”,这个“定”不是“一定”的“定”,而是“镇定”的“定”,人要是镇定下来,是能够应付各种各样的灾难。
3楼2013-12-27 08:44:36
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forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖


vividhu: 金币+1, 有帮助, 那我再看看去吧 2013-12-27 11:02:22
那就是无序没弄明白。
4楼2013-12-27 09:50:00
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情化钾

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by vividhu at 2013-12-27 08:44:36
checkcif已经没有明显的错误了,无序我也不清楚啊,当时这个无序分的本来就不是很清楚,diamond我画不好,主要是生成的图片,感觉不清晰啊...

diamond的分辨率设置成600,然后出的图才清晰
5楼2014-01-13 19:50:46
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vividhu

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 情化钾 at 2014-01-13 19:50:46
diamond的分辨率设置成600,然后出的图才清晰...

嗯嗯,设置好了,谢谢
“人定胜天”,这个“定”不是“一定”的“定”,而是“镇定”的“定”,人要是镇定下来,是能够应付各种各样的灾难。
6楼2014-01-14 10:59:30
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