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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » ortep diagram的键正常，但是packing diagram时产生不存在的键
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vividhu

木虫 (正式写手)

[求助] ortep diagram的键正常，但是packing diagram时产生不存在的键 已有1人参与

最近在用xp做晶胞堆积图，在画ORTEP diagram（图1）的时候还是正确的， O4‘A 和O4A，可能因为没有显示氢键，所以看起来还是正常的。
但是在packing diagram中(图2)，就看到产生了不存在的键，就是O和H被连接在一起了，具体有O4’-H13A、O4‘-H13B、O4-H13C和O4-H13D这一类型的键，我尝试了undo Atom1 atom2的命令，可是还是删不掉啊，是我的解析文件里面错误了吗？这个怎么改正呢？
ortep diagram的键正常，但是packing diagram时产生不存在的键
图1
ortep diagram的键正常，但是packing diagram时产生不存在的键-1
图2
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“人定胜天”，这个“定”不是“一定”的“定”，而是“镇定”的“定”，人要是镇定下来，是能够应付各种各样的灾难。
1楼 2013-12-25 11:34:18
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forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
vividhu: 金币+1, ★有帮助 2013-12-27 08:43:16
checkcif还有明显的错误没有？无序处理是否得当？是在不行就换别的软件，比如Diamond。
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2楼2013-12-26 21:27:52
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vividhu

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by forever1706 at 2013-12-26 21:27:52
checkcif还有明显的错误没有？无序处理是否得当？是在不行就换别的软件，比如Diamond。

checkcif已经没有明显的错误了，无序我也不清楚啊，当时这个无序分的本来就不是很清楚，diamond我画不好，主要是生成的图片，感觉不清晰啊
赞一下 回复此楼
“人定胜天”，这个“定”不是“一定”的“定”，而是“镇定”的“定”，人要是镇定下来，是能够应付各种各样的灾难。
3楼2013-12-27 08:44:36
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forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
vividhu: 金币+1, ★有帮助, 那我再看看去吧 2013-12-27 11:02:22
那就是无序没弄明白。
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4楼2013-12-27 09:50:00
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情化钾

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by vividhu at 2013-12-27 08:44:36
checkcif已经没有明显的错误了，无序我也不清楚啊，当时这个无序分的本来就不是很清楚，diamond我画不好，主要是生成的图片，感觉不清晰啊...

diamond的分辨率设置成600，然后出的图才清晰
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5楼2014-01-13 19:50:46
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vividhu

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 情化钾 at 2014-01-13 19:50:46
diamond的分辨率设置成600，然后出的图才清晰...

嗯嗯，设置好了，谢谢
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“人定胜天”，这个“定”不是“一定”的“定”，而是“镇定”的“定”，人要是镇定下来，是能够应付各种各样的灾难。
6楼2014-01-14 10:59:30
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