24小时热门版块排行榜    

查看: 1589  |  回复: 28
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

肖thest

木虫 (小有名气)

神级

[求助] 求助引物设计:前前后后三次都有问题,请大神帮帮忙…………感激不尽已有2人参与

共1067bp, 粗线是我需要看的基因区域,想设计一对引物,普通PCR后测序(单向测,所以上游或者下游引物离目标区域起码60bp),用primer或者NCBI primer blast设计了三次,每次引物特异性较差或者退火温度摸不出来。
下面是我的序列:
TGAGACTTTT CCGTTGCCGC TGGGAGCCGG AGGCGCGGGG ACCTCTTGGC GCGACGCTGC
CCCGCGAGGA GGCAGGACTT GGGGACCCCA GACCGCCTCC CTTTGCCGCC GGGGACGCTT
GCTCCCTCCC TGCCCCCTAC ACGGCGTCCC TCAGGCGCCC CCATTCCGGA CCAGCCCTCG
GGAGTCGCCG ACCCGGCCTC CCGCAAAGAC TTTTCCCCAG ACCTCGGGCG CACCCCCTGC
ACGCCGCCTT CATCCCCGGC CTGTCTCCTG AGCCCCCGCG CATCCTAGAC CCTTTCTCCT
CCAGGAGACG GATCTCTCTC CGACCTGCCA CAGATCCCCT ATTCAAGACC ACCCACCTTC
TGGTACCAGA TCGCGCCCAT CTAGGTTATT TCCGTGGGAT ACTGAGACAC CCCCGGTCCA
AGCCTCCCCT CCACCACTGC GCCCTTCTCC CTGAGGACCT CAGCTTTCCC TCGAGGCCCT
CCTACCTTTT GCCGGGAGAC CCCCAGCCCC TGCAGGGGCG GGGCCTCCCC ACCACACCAG
CCCTGTTCGC GCTCTCGGCA GTGCCGGGGG GCGCCGCCTC CCCCATGCCG CCCTCCGGgc
tgcggctgct gcCgctgctgcta ccgctgctgt ggctactggt gctgACGCCT GGCCGGCCGG CCGCGGGACT
ATCCACCTGC AAGACTATCG ACATGGAGCT GGTGAAGCGG AAGCGCATCG AGGCCATCCG
CGGCCAGATC CTGTCCAAGC TGCGGCTCGC CAGCCCCCCG AGCCAGGGGG AGGTGCCGCC
CGGCCCGCTG CCCGAGGCCG TGCTCGCCCT GTACAACAGC ACCCGCGACC GGGTGGCCGG
GGAGAGTGCA GAACCGGAGC CCGAGCCTGA GGCCGACTAC TACGCCAAGG AGGTCACCCG
CGTGCTAATG GTGGAAACCC ACAACGGTGA GCTCGGAGGG GCAGGGGAGC CGGGAGGGGG
GCCCCCAGGG GGCGCCGGAG TGCCGGGGCC ACGGGTAGGA AGTGACTGGC AGAAGAAACT
GGCTGGAGGA AGAGGACACC CCGGGGCAAA GGGA

[ Last edited by 肖thest on 2013-12-22 at 13:43 ]
回复此楼
thest
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

肖thest

木虫 (小有名气)

神级

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by woshishui916 at 2013-12-22 18:35:26
上游:AAGCCTCCCCTCCACCACTG
下游:CCGCAGCTTGGACAGGATCT
肯定能出来
出不来你再联系我

回复,很感谢,但是我看了您设计的结果,因为粗线是我要看的目标区域,可您设计的好像是338bp,我的目标区域没有包括全哦。还是很谢谢
thest
3楼2013-12-22 19:48:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 29 个回答

woshishui916

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
肖thest: 金币+15, ★★★★★最佳答案, 很感激,很nice的人 2013-12-22 23:13:55
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-01-27 20:45:26
上游:AAGCCTCCCCTCCACCACTG
下游:CCGCAGCTTGGACAGGATCT
肯定能出来
出不来你再联系我

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-12-22 18:35:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

肖thest

木虫 (小有名气)

神级

引用回帖:
3楼: Originally posted by 肖thest at 2013-12-22 19:48:34
回复,很感谢,但是我看了您设计的结果,因为粗线是我要看的目标区域,可您设计的好像是338bp,我的目标区域没有包括全哦。还是很谢谢...

我在分析下,好像看错了。呜呜,我blast下
thest
4楼2013-12-22 19:52:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woshishui916

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你不是说黑体的是你想要的吗?
难不成上面的序列你全部想要?
5楼2013-12-22 19:53:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 关系导师与研究生的关系的一点看法 +6 平凡依旧 2025-01-01 18/900 2025-01-01 17:37 by 走了002
[教师之家] 小教师身体第一,健康第一,保命最重要 +6 guilin2018 2024-12-30 9/450 2025-01-01 15:30 by huixiong0627
[教师之家] 在高校没有人才帽子是不是基本没有生存空间了 +4 akslis2024 2025-01-01 11/550 2025-01-01 13:12 by 走了002
[硕博家园] 江苏大学杨孙圣课题组 +4 姜一雪月 2024-12-31 5/250 2025-01-01 12:53 by aasahr
[教师之家] [吃瓜]网传江苏某高校人事处处长被打 +13 Blues汪 2024-12-27 14/700 2025-01-01 12:49 by 起个口舍名?
[教师之家] 咨询一下,马上要申报国家自然基金了,是不是又要开始造假了? +8 akslis2024 2024-12-29 9/450 2025-01-01 10:59 by 平凡依旧
[教师之家] 浙大女生被MIT开除,女生称自己在浙江大学本科阶段就一直用这种方式收集数据发论文 +16 苏东坡二世 2024-12-27 16/800 2024-12-31 22:30 by ipig611
[教师之家] nature comm, 浙大今年293篇,北大,288篇 +13 babu2015 2024-12-26 16/800 2024-12-31 21:13 by jyang1999
[考博] 25年博士名额2名 +7 dochem 2024-12-26 7/350 2024-12-31 17:30 by 风雨读书路
[教师之家] 多所高校已采取教师退出机制或教师末位淘汰机制。大家怎么看? +14 LNP@mRNA 2024-12-27 27/1350 2024-12-31 17:19 by LNP@mRNA
[论文投稿] 学位论文漏引了一篇文献,怎么办 20+7 青椒1234 2024-12-25 12/600 2024-12-31 12:03 by 木木A123
[考研] 300求调剂 +4 李花花1 2024-12-29 6/300 2024-12-31 11:30 by 535743368
[考研] 考研英语背单词 +6 Dicyw 2024-12-25 8/400 2024-12-31 08:38 by (子鼠)
[育儿交流] 宝宝总是红屁屁怎么办 +6 wjy3004 2024-12-26 7/350 2024-12-31 08:27 by zeolitess
[基金申请] 现在报基金要打招呼吗 +9 akslis2024 2024-12-25 13/650 2024-12-30 18:06 by 走了002
[论文投稿] 工程科学学报期刊 5+3 巧巧玲 2024-12-30 4/200 2024-12-30 14:38 by TopEdit
[硕博家园] (常年有效)中外知名高校(QS排名前3)联培 - 招募大模型及强化学习博士生和博士后 +3 cowhorce 2024-12-29 3/150 2024-12-29 18:40 by 55bh@2u5
[考博] 矿加博士报考 +4 阿斯蒂芬11234 2024-12-25 4/200 2024-12-28 14:46 by 跳鱼拨刺
[考博] HIT研三申博自荐-超快激光应用方向 +9 天天yyds 2024-12-25 12/600 2024-12-27 14:17 by 明海天涯
[硕博家园] 膜截留分子量曲线拟合 +6 yfdqyr 2024-12-25 7/350 2024-12-26 22:54 by hzlhm
信息提示
请填处理意见