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1楼2013-12-20 18:31:55

chenkunkun

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【答案】应助回帖

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同求啊如何消除虚频请问你这个声子谱是如何算出来的呢除了siesta 还用其它的辅助软件了吗

努力

2楼2013-12-20 22:33:29

leila3409

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2楼: Originally posted by chenkunkun at 2013-12-20 22:33:29
同求啊如何消除虚频请问你这个声子谱是如何算出来的呢除了siesta 还用其它的辅助软件了吗

只用SIESTA,没有用其他辅助软件

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3楼2013-12-21 06:42:51

anionxt

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Siesta算力常数可靠性比较差,试试Quantum Espresso或者vasp

4楼2013-12-21 12:38:04

leila3409

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4楼: Originally posted by anionxt at 2013-12-21 12:38:04
Siesta算力常数可靠性比较差,试试Quantum Espresso或者vasp

我一系列工作都是用SIESTA做的，晶格常数，体弹模量，各个弹性常数，以及其他性质都是用这一套设置做的。赝势和基函数都是优化过得，适合我关注状态下的性质计算。我希望可以找到计算错误的原因，不希望改软件。毕竟换了软件，各种相关设置都变化了，未必可以用来解释SIESTA计算其他性质时观察到的现象。

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5楼2013-12-21 13:11:12

xhzha

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EnergyCutoff 的值好大，有验证需要那么大么，不浪费时间么？没有看到你力的收敛标准，可以在优化的时候将力的收敛标准设高一些。如若再出现虚频，可以考虑将你的虚频的对应的坐标（对应在Eigenvector里)加到原子坐标优化再计算。还有一种是优化比较大的超胞，然后用超胞算声子谱。如果都不行，我也没辙了~

6楼2013-12-22 13:50:38

leila3409

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6楼: Originally posted by xhzha at 2013-12-22 13:50:38
EnergyCutoff 的值好大，有验证需要那么大么，不浪费时间么？没有看到你力的收敛标准，可以在优化的时候将力的收敛标准设高一些。如若再出现虚频，可以考虑将你的虚频的对应的坐标（对应在Eigenvector里)加到原 ...

嗯，很可能是晶胞不够大，我昨天也想到了。我用原胞在各方向扩大5倍，但因为基失不正交，所以由周期性引起的晶胞间相互作用可能还是比较大，我已经将扩展胞正交，现在有250个原子了。
energycutoff 会对别的性质有影响，这里看来对声子影响不大，我接下来还用300就好了。
另外你说的按照波矢移动原子位置，我不懂，可否详细解释一下？谢谢！

扩展胞坐标
0 0 0
0.5 0.5 0.5
虚频位置大概0.2 (2 pi /a)
你说的移动应该如何操作？谢谢！

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7楼2013-12-23 08:11:20

xhzha

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7楼: Originally posted by leila3409 at 2013-12-23 08:11:20
嗯，很可能是晶胞不够大，我昨天也想到了。我用原胞在各方向扩大5倍，但因为基失不正交，所以由周期性引起的晶胞间相互作用可能还是比较大，我已经将扩展胞正交，现在有250个原子了。
energycutoff 会对别的性质有 ...

在算声子的输入文件中加上Eigenvectors True 这个命令，就会得到system.vectors文件，里面会有频率值对应的坐标，找到虚频对应的坐标加到你优化后的原子坐标，然后拿新得到的原子坐标去优化。这样的帖子应该蛮多的。

8楼2013-12-23 10:12:33