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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 声子谱 虚频 求助
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leila3409

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 声子谱 虚频 求助 已有4人参与

本人用SIESTA算Nb的声子谱，扩散晶胞为原胞的5*5*5倍，单边长度为3.2985*5=16.5 Ang，共125个原子。EngeryCutoff 选1200 Ry，K点用6*6*6 ，MP展宽用0.3 eV，电子收敛标准为 1.d-5， 原子移动位移为0.04 Bohr。

计算的结果总在GAMMA点附近出现虚频。如下图及与实验值的对比。正确的结果应该是在Gamma附近的声学支出现一个小节，kink，但不应该是虚频。。。

本人所用晶格常数为SIESTA优化后的结果3.2985 Ang,实验值为3.3Ang.

求指教！
声子谱 虚频 求助
计算值


声子谱 虚频 求助-1
实验值
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1楼 2013-12-20 18:31:55
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chenkunkun

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
identation: 金币+2, 谢谢交流 2013-12-21 13:59:47
同求啊 如何消除虚频   请问你这个声子谱是如何算出来的呢  除了siesta 还用其它的辅助软件了吗
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努力
2楼2013-12-20 22:33:29
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leila3409

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chenkunkun at 2013-12-20 22:33:29
同求啊 如何消除虚频   请问你这个声子谱是如何算出来的呢  除了siesta 还用其它的辅助软件了吗

只用SIESTA,没有用其他辅助软件

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3楼2013-12-21 06:42:51
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anionxt

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
identation: 金币+2, 谢谢交流 2013-12-21 13:59:55
Siesta算力常数可靠性比较差,试试Quantum Espresso或者vasp
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4楼2013-12-21 12:38:04
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leila3409

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by anionxt at 2013-12-21 12:38:04
Siesta算力常数可靠性比较差,试试Quantum Espresso或者vasp

我一系列工作都是用SIESTA做的，晶格常数，体弹模量，各个弹性常数，以及其他性质都是用这一套设置做的。赝势和基函数都是优化过得，适合我关注状态下的性质计算。我希望可以找到计算错误的原因，不希望改软件。毕竟换了软件，各种相关设置都变化了，未必可以用来解释SIESTA计算其他性质时观察到的现象。

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5楼2013-12-21 13:11:12
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xhzha

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
leila3409: 金币+50, ★★★很有帮助 2013-12-23 08:00:46
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-12-23 21:34:33
EnergyCutoff 的值好大， 有验证需要那么大么，不浪费时间么？没有看到你力的收敛标准， 可以在优化的时候将力的收敛标准设高一些。 如若再出现虚频， 可以考虑将你的虚频的对应的坐标（对应在Eigenvector里)加到原子坐标优化再计算。 还有一种是优化比较大的超胞，然后用超胞算声子谱。如果都不行，我也没辙了~
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6楼2013-12-22 13:50:38
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leila3409

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by xhzha at 2013-12-22 13:50:38
EnergyCutoff 的值好大， 有验证需要那么大么，不浪费时间么？没有看到你力的收敛标准， 可以在优化的时候将力的收敛标准设高一些。 如若再出现虚频， 可以考虑将你的虚频的对应的坐标（对应在Eigenvector里)加到原 ...

嗯，很可能是晶胞不够大，我昨天也想到了。我用原胞在各方向扩大5倍，但因为基失不正交，所以由周期性引起的晶胞间相互作用可能还是比较大，我已经将扩展胞正交，现在有250个原子了。
energycutoff 会对别的性质有影响，这里看来对声子影响不大，我接下来还用300就好了。
另外你说的按照波矢移动原子位置，我不懂，可否详细解释一下？谢谢！

扩展胞坐标
0 0 0
0.5 0.5 0.5
虚频位置大概0.2 (2 pi /a)
你说的移动应该如何操作？谢谢！

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7楼2013-12-23 08:11:20
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xhzha

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-12-23 21:35:04
引用回帖:
7楼: Originally posted by leila3409 at 2013-12-23 08:11:20
嗯，很可能是晶胞不够大，我昨天也想到了。我用原胞在各方向扩大5倍，但因为基失不正交，所以由周期性引起的晶胞间相互作用可能还是比较大，我已经将扩展胞正交，现在有250个原子了。
energycutoff 会对别的性质有 ...

在算声子的输入文件中加上Eigenvectors  True  这个命令，就会得到system.vectors文件，里面会有频率值对应的坐标，找到虚频对应的坐标加到你优化后的原子坐标，然后拿新得到的原子坐标去优化。这样的帖子应该蛮多的。
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8楼2013-12-23 10:12:33
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tinkie0411

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by leila3409 at 2013-12-23 08:11:20
嗯，很可能是晶胞不够大，我昨天也想到了。我用原胞在各方向扩大5倍，但因为基失不正交，所以由周期性引起的晶胞间相互作用可能还是比较大，我已经将扩展胞正交，现在有250个原子了。
energycutoff 会对别的性质有 ...

请问楼主 你将扩展包变为正交后 与之前的声子谱有差别吗？ 谢谢
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9楼2014-03-14 17:58:49
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chuanghua304

禁虫 (职业作家)
本帖内容被屏蔽
10楼2014-03-16 17:01:11
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