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fengmx2010

木虫 (著名写手)

[求助] 利用gateway载体做RNAi和overexpression出现的问题,懂质粒构造的进!!! 已有3人参与

大家好,我现在想通过gateway技术构建一种基因的RNAi和Overexpression表达载体。Destination plasmid是从国外购买的,这两种载体的图谱如下。
我已经将目的基因通过带有attB1和attB2位点的引物克隆得到了。BP反应和LR反应已经做完了,依据致死基因和T-DNA外面链霉素抗性以及酶切验证,三个把关,我感觉目的基因已经导入到正确位置了。
现在的问题是,我将纯化好的质粒想导入发根农杆菌中,选择了A4(带有利福平抗性)和AT15834野生型(无任何抗生素抗性)两种菌株。可是怎么也筛不到阳性克隆,要么是污染,要么是什么都不长!我用的是链霉素(100ug/ml)和利福平(50ug/ml)平板,不知道是不是链霉素抗性基因不能在农杆菌中表达啊?卡那抗性能在农杆菌中表达吗?内含子之间的CmR又是在哪里表达的呢?我查了文献,但是还是一头雾水。关键是,有没有一种方法,可以从基因序列直接推理出它在某种菌内的表达情况??
利用gateway载体做RNAi和overexpression出现的问题,懂质粒构造的进!!!
overexpression用


利用gateway载体做RNAi和overexpression出现的问题,懂质粒构造的进!!!-1
RNAi用,内含子之间有一cat基因,LB RB之间有一kana抗性基因。
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爱你一万年
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Huobol

至尊木虫 (著名写手)

顶你 美女博士 虽然俺不懂 祝福你更快得到应助
让羽毛再飞一会儿
2楼2013-12-19 22:48:33
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爱笑的大脸猫

新虫 (小有名气)

这位美女博士我也要买载体?能把买载体的方式或链接给我吗?在下感激不尽!
越努力,越幸运!
3楼2013-12-24 20:49:58
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fengmx2010

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 爱笑的大脸猫 at 2013-12-24 20:49:58
这位美女博士我也要买载体?能把买载体的方式或链接给我吗?在下感激不尽!

不好意思,回复晚了。这些载体是从国外买的,给你一个网址哈:http://gateway.psb.ugent.be/search
爱你一万年
4楼2013-12-30 21:35:20
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爱笑的大脸猫

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by fengmx2010 at 2013-12-30 21:35:20
不好意思,回复晚了。这些载体是从国外买的,给你一个网址哈:http://gateway.psb.ugent.be/search...

好的,谢谢
越努力,越幸运!
5楼2013-12-30 22:01:44
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beimi

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

首选你的entry vector是什么抗性?其次你的基因放到entry vector以后测序了没有?你的能不能直接做LR reaction?
6楼2013-12-31 08:00:11
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不喝咖啡

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

表达情况是什么意思?一般只要启动子合适就可以表达的,kan抗性一般是可以在农杆菌中表达的,你构建的质粒测序验证过了吗,用的什么方法转化农杆菌?
7楼2013-12-31 12:20:16
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fengmx2010

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by beimi at 2013-12-31 08:00:11
首选你的entry vector是什么抗性?其次你的基因放到entry vector以后测序了没有?你的能不能直接做LR reaction?

entry vector就是pDNOR221,kana抗性。没有测序。可以直接做LR反应的。关键我的问题不是这个。你答非所问,所以不能给你金币。谢谢你的应助帖
爱你一万年
8楼2014-01-01 17:16:03
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fengmx2010

木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 不喝咖啡 at 2013-12-31 12:20:16
表达情况是什么意思?一般只要启动子合适就可以表达的,kan抗性一般是可以在农杆菌中表达的,你构建的质粒测序验证过了吗,用的什么方法转化农杆菌?

我想问能不能表达。怎样算启动子合适呢?kana抗性“一般”是可以在农杆菌表达的?CmR呢?为什么放在内含子中间呢?
爱你一万年
9楼2014-01-01 17:17:29
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2014-01-29 17:10:33
我们实验室农杆菌是GV3101,培养基是YEB里面加卡纳,利福平,羧苄,mg离子。也可以加氨苄。
不同的农杆菌好像抗生素是不一样的。
10楼2014-01-03 15:21:54
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