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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS分子建模求助
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xueyiran2007

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by jerkwin at 2013-12-20 07:15:25
MS不支持, 用其他的语言把坐标处理一下就是了...

多谢大神！能讲一下大致步骤怎么去除周期性吗？我现在还不清楚其他语言怎么就和MS结合到一块了，C语言、matlab我会用，但是怎么跟MS关联，还不清楚
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LiveandLearn
11楼2013-12-21 08:34:05
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-21 10:55:01
xueyiran2007: 金币+2, ★有帮助 2013-12-21 23:08:43
引用回帖:
11楼: Originally posted by xueyiran2007 at 2013-12-21 08:34:05
多谢大神！能讲一下大致步骤怎么去除周期性吗？我现在还不清楚其他语言怎么就和MS结合到一块了，C语言、matlab我会用，但是怎么跟MS关联，还不清楚...

建模无非就是处理体系中原子的坐标
用程序产生出符合你要求的坐标, 导入到MS中就可以了
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12楼2013-12-21 09:30:50
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Tower.Tsu

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xueyiran2007: 金币+8, ★★★很有帮助 2013-12-21 23:07:57
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2013-12-22 12:15:51
引用回帖:
10楼: Originally posted by xueyiran2007 at 2013-12-21 08:27:52
多谢大神！弧面我已经建好了，如上图，怎么把其他分子模型放到弧面上？我用bulid layer对接弧面与其他分子模型，但两者直接由一个空间层，不能达到上图所示的接触效果；我用cleave surface建立平面，建立真空层，利 ...

其实可以直接将液滴模型建好，复制粘贴上去，挪动原子位置控制间距就好了哈。。。

去处周期性在tool有这个功能项的哈

ms可以编程，用的是perl校本，语言其实和c，matlab等都是相通的。可以help文件了解下，在建模及导出感兴趣区域原子的动态信息方面还是很有用的。。。

[ 发自小木虫客户端 ]
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不再是一个人，处处时时想着念着的都是我们...
13楼2013-12-21 11:02:49
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superstamina

金虫 (小有名气)
MS中怎么编程实现建模呢？
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14楼2013-12-21 11:55:10
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xueyiran2007

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by Tower.Tsu at 2013-12-21 11:02:49
其实可以直接将液滴模型建好，复制粘贴上去，挪动原子位置控制间距就好了哈。。。

去处周期性在tool有这个功能项的哈

ms可以编程，用的是perl校本，语言其实和c，matlab等都是相通的。可以help文件了解下，在 ...

大神，去处周期性在tool有这个功能项？我没找到啊，能再指点一下吗？剩下分全给大神
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LiveandLearn
15楼2013-12-23 02:23:38
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Tower.Tsu

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2013-12-23 16:12:51
xueyiran2007: 金币+12, ★★★很有帮助 2013-12-24 09:03:54
引用回帖:
15楼: Originally posted by xueyiran2007 at 2013-12-23 02:23:38
大神，去处周期性在tool有这个功能项？我没找到啊，能再指点一下吗？剩下分全给大神...

不好意思，说错了，是在Build->Symmetry->Non-Periodic Superstructure，建立非周期性结构！
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不再是一个人，处处时时想着念着的都是我们...
16楼2013-12-23 09:55:49
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