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candy_aoyan

新虫 (初入文坛)

[交流] 小白请教关于分子对接方面的问题 已有2人参与

各位大侠:
我是一学计算机的娃,但毕业设计导师让我做关于分子对接的,生物知识完全不懂的我,从零开始的我,很是郁闷,我按照autodock中文教程上的介绍,做了HSG1和ind的对接,但不明白的是,我首先下载下来的是1HSG,然后将蛋白分子和配体分子分开,接着又将他们对接起来,这样做的意义是什么啊?还有就是对接好了,我怎么去分析我的结果呢?。。。。。。。各位大侠,行行好,回回帖吧!呜呜呜呜呜。。。。!
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candy_aoyan

新虫 (初入文坛)

2楼2013-12-18 10:54:19
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pymol

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-23 08:42:54
对接教程就是让你熟悉整个过程的,以此类推,换成自己的蛋白,自己研究的配体就需要慎重考虑了
比如说 受体的活性位点问题?配体的结合模式?怎么筛选配体?
3楼2013-12-22 16:14:41
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mliwang

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
从数据库下下来的蛋白分子和配体分子只是在一个文件里面刚性的,但是分子对接却是在模拟化学反应,两种分子结合是有能量变化啥的的
4楼2016-04-16 21:28:13
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